Archwilio Mecanwaith Gweithredu Cistanche Cyfanswm Glycosidau Ar Glefyd Llidiol y Coluddyn Seiliedig Ar Ffarmacoleg Rhwydwaith Ac Arbrofion Anifeiliaid Ⅲ

3 Canlyniadau a dadansoddiad

3.1 Dadansoddiad o dargedau cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa a thargedau afiechyd

Mewnforio'r ffeiliau strwythur tri dimensiwn ocynhwysion actifi mewn i gronfa ddata PharmMapper i gael y pwyntiau targed cyfatebol sy'n cyfateb i wahanol gynhwysion. Defnyddiwyd cronfa ddata UniProt i gael yr enw protein a gwybodaeth enw genyn sy'n cyfateb i bob targed. Gan gyfuno'r pwyntiau targed sy'n cyfateb i'r saith cydran, cafwyd cyfanswm o 354 o dargedau. Yn y gronfa ddata GeneCards, chwiliwyd genynnau perthnasol gan ddefnyddio'r allweddair "clefyd coluddyn llidus", a didolwyd y canlyniadau chwilio, a chafwyd targedau 7851 yn olaf. Defnyddiwch ddigwyddiadau i lunio diagram Venn ar-lein i gael croestoriad targedau cynhwysion actif Cistanche tubulosa a phwyntiau targed IBD. Fel y dangosir yn Ffigur 1, 254 targed y cynhwysyn gweithredol oCistanche tubulosasy'n cael effaith amddiffynnol ar IBD.

Ffig.2 Diagram rhwydwaith PPI o dargedau cyffredin

Ffig.5 Cydran-targed-rhwydwaith llwybr

Ffig.7 Mae cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa yn is-reoleiddio mRNA llwybrau signalau TGF- a mTOR mewn llygod IBD

3.4 Mae cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa yn gwella sgôr DAI a achosir gan DSS

Dangosodd canlyniadau'r profion, ac eithrio'r grŵp CZ, fod gan y tri grŵp arall raddau amrywiol o golli pwysau a gwaed ocwlt fecal (Ffigur 6). Yn eu plith, roedd gan y grŵp rheoli DSS y gyfradd colli pwysau corff uchaf, y gwaed fecal mwyaf difrifol, y DAI uchaf, a gwaedu fecal amlwg ar y 6ed diwrnod. Ar ôl ymyrraeth cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa, gostyngodd sgôr DAI yn raddol, a gostyngodd sefyllfa gwaed ocwlt yn raddol. Roedd gan y grŵp HZ y gyfradd colli pwysau corff isaf a'r swm isaf o waed cudd mewn feces. Dangosodd y canlyniadau fod cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa wedi gwella'r ymatebion ffisiolegol a achosir gan glefyd llidiol y coluddyn.

ATODIAD CISTANCHE AR GYFER TRINIAETH IBD PHGS75% ECH 30% DEDDF 12%

3.5 Mae cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa yn is-reoleiddio IBD

Mynegi llwybrau signalau mTOR a TGF yn llwybrau signalau dueg y llygoden Mae mTOR a llwybrau signalau TGF yn ddau lwybr signalau pwysig sy'n actifadu ymatebion ymfflamychol. Canfuwyd mynegiant mTOR a TGF- ym meinwe dueg llygod gan qRT-PCR. Dangosodd y canlyniadau fod mynegiant mRNA mTOR a TGF- yn y grŵp rheoli DSS llygod wedi cynyddu'n sylweddol o'i gymharu â'r hyn a geir yn y llygod arferol. O'i gymharu â llygod rheoli DSS, O'i gymharu â Cistanche tubulosa, gostyngwyd mynegiant llygod mTOR a TGF- mewn llygod yn sylweddol ar ôl ymyrraeth Cistanche tubulosa. Yn eu plith, y grŵp dos uchel oedd â'r gostyngiad mwyaf arwyddocaol, ac roedd y lefel mynegiant yn y bôn yn gyson â lefel y grŵp arferol (Ffigur 7). Dangosodd y canlyniadau fod cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa yn is-reoleiddio mynegiant llwybrau signalau mTOR a TGF.

Ffig.8 Map gwres 2-clystyru helaethrwydd swyddogaethol PICRUSt

3.6 PICRUSt2 dadansoddiad anodi swyddogaethol

Offeryn biowybodeg yw PICRUSt2 ar gyfer rhagfynegi swyddogaeth metagenomig yn seiliedig ar rRNA biolegol 16S, coeden ASV, a gwybodaeth genynnau ASV yng nghronfa ddata Greengene. Defnyddiwyd cronfa ddata Dethol COG ar gyfer rhagfynegiad swyddogaethol, a dangosodd y canlyniadau fod swyddogaethau fflora berfeddol yn ymwneud yn bennaf â phrosesu RNA; strwythur cromatin a dynameg; rheoli cylchred gell, cellraniad, segmentu cromosomau; mecanwaith amddiffyn; signalu cellfur/cellbilen/biogenesis amlen; celloedd Mae ganddo fwy nag 20 o swyddogaethau fel strwythur allgellog; cludiant mewngellol, secretion, a chludo fesiglau; cynhyrchu a throsi ynni; cludo carbohydradau a metaboledd. Dewiswch y 15 nodwedd fwyaf cyffredin a'u helaethrwydd o wybodaeth ym mhob samplMae map gwres (Ffigur 8) yn cael ei lunio er gwybodaeth ac wedi'i glystyru o wahanol lefelau swyddogaethol.

O'i gymharu â'r grŵp CZ, roedd gan lygod grŵp rheoli DZ COG1132 (system gludo aml-gyffuriau math ABC), COG0745 (rheoleiddiwr ymateb rhwymol DNA), COG1131 (system cludo amlgyffuriau math ABC), COG1961 (ailgyfuniad DNA safle-benodol yn ymwneud â y Pin invertase DNA ), COG0438 (Glycosyltransferase dan sylwmewn biosynthesis cellfur), COG0534 (Na +-wedi'i yrrupwmp efflux multidrug), COG0642 (Signal transduction histidine kinase), COG1595 (DNA-gyfeiriedig RNA polymerase is-uned sigma arbenigol), COG0463 (Endonuclease), COG4974 (Safle-benodol recombinase XerD), COG2207 (ArdingaC-domains-typea a DNA sy'n cynnwys proteinau), COG1136 (system allforio lipoprotein tebyg i ABC), a COG1309 (rheoleiddiwr trawsgrifio rhwymol DNA) annormaleddau mynegiant genynnau swyddogaethol. Mae'r genynnau hyn yn ymwneud yn bennaf â: V: mecanwaith amddiffyn; T: mecanwaith trawsgludo signal; M: cellfur/cellbilen/biogenesis amlen; I: cludo lipid a metaboledd; K: trawsgrifio; L: atgynhyrchu, ailgyfuno a thrwsio.

Ar ôl i'r chwe swyddogaeth hyn gael cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa, roedd mynegiant y gwahanol swyddogaethau ffisiolegol hyn yn agos at rai'r grŵp arferol. O'u cymharu â llygod yn y grwpiau CZ a DZ, roedd gan lygod yn y grŵp HZ fynegiant uchel o enynnau COG1028 (teulu dehydrogenase alcohol cadwyn fer) a COG0451 (Epimerase Niwcleoside-ffosffad-siwgr). Mae'r ddau enyn hyn yn gysylltiedig ag I: cludiant lipid a metaboledd. Ac M: Mae cysylltiad agos rhwng swyddogaethau cellfur/ cellbilen/biogenesis amlen. Felly, dyfalir y gall cyfanswm glycosidau Cistanche tubulosa reoleiddio difrod llygod IBD trwy reoleiddio metaboledd lipid, metaboledd glwcos a mecanweithiau trawsgludo signal amddiffyn cysylltiedig mewn llygod.