Yr Ymchwil ar Rywogaethau Cistanche

Mar 22, 2022

Najibeh Ataeia,b, Gerald M. Schneeweissc,⁎, Miguel Angel Garcíad,e,1, Michael Kruger, Marcus Lehnerta, Jafar Valizadehf, Dietmar Quandta,⁎

Sefydliad Nees ar gyfer Bioamrywiaeth Planhigion, Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Meckenheimer Allee 170, 53115 Bonn, yr Almaen

b Cyfarwyddiaeth Gyffredinol Sefydliad Ymchwil Amaethyddol Afghanistan (ARIA), Y Weinyddiaeth Amaethyddiaeth, Dyfrhau a Da Byw, Badam Bagh, Kabul, Afghanistan

c Adran Botaneg ac Ymchwil Bioamrywiaeth, Prifysgol Fienna, Rennweg 14, A-1030 Fienna, Awstria

d Adran Bioleg, Prifysgol Toronto yn Mississauga, 3359 Mississauga, Canada

e Real Jardín Botánico, CSIC, Plaza de Murillo 2, 28014 Madrid, Sbaen f Adran Bioleg, Prifysgol Sistan a Baluchistan, Zahedan, Iran

Cyswllt:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791


Haniaethol

Mae perthynas ffylogenetig o linachau parasitig nad ydynt yn ffotosynthetig ac oddi mewn iddynt yn hynod o hysbys, sy'n effeithio'n negyddol ar ein dealltwriaeth o blanhigion parasitig. Mae hyn hefyd yn wir amCistanche(Orobanchaceae), genws o'r Hen Fyd gyda thua dau ddwsin o rywogaethau, nad yw eu perthnasoedd wedi cael sylw eto gan ddefnyddio dulliau ffylogenetig moleciwlaidd. Yma rydym yn casglu perthnasoedd ffylogenetig o fewn y genws, gan ddefnyddio samplu tacsonomaidd a daearyddol eang sy'n cwmpasu'r holl grwpiau infragenerig nodedig yn flaenorol a'r rhan fwyaf o'r rhywogaethau a gydnabyddir ar hyn o bryd. Dadansoddwyd matrics cyfun o dri marciwr plastid (trnL-trnF, gan gynnwys yr intron trnL a'r spacer rhynggenig (IGS), trnS-trnfM IGS, a psbA-trnH IGS) ac un marciwr niwclear (ITS) gan ddefnyddio'r parsimony mwyaf, y tebygolrwydd mwyaf , a chasgliad Bayesaidd.CistancheMae'n perthyn i bedwar clawdd sydd wedi'u cefnogi'n dda ac sydd wedi'u gwahaniaethu'n ddaearyddol: Clade Dwyrain Asia, Clade Gogledd-orllewin Affrica, Clade De-orllewin Asia, a Clade eang. O'r rheini, dim ond Clad Dwyrain Asia sy'n cyfateb i adran dacsonomig a gydnabuwyd yn flaenorol, tra bod y lleill naill ai'n cynnwys aelodau o ddwy neu dair adran (Clâd Eang a Chlâd De-orllewin Asia, yn y drefn honno) neu nad ydynt wedi'u cydnabod yn dacsonomaidd hyd yn hyn (Clâd Gogledd-orllewin Affrica) . Tra bod Clad De-orllewin Asia yn arddangos strwythur ffylogenetig cryf ymhlith ac yn rhannol o fewn rhywogaethau (mae Clad Dwyrain Asia a Chlud gogledd-orllewin Affrica yn monospecific), mae cydraniad ffylogenetig o fewn y Clad Eang yn aml yn isel ac yn cael ei rwystro gan anghysondebau rhwng marcwyr niwclear a phlastig. Mae data moleciwlaidd a morffolegol yn dangos bod amrywiaeth rhywogaethau yn Cistanche yn cael ei danamcangyfrif ar hyn o bryd.

Geiriau allweddol:CistancheGwesteiwr, Orobanchaceae, Parasit, Phylogeny, Systemateg, Tacsonomeg

Cistanche deserticola

Cistanche herba Detholiad Powdwr o Chengdu Wecistanche

1. Rhagymadrodd

Mae'r Orobanchaceae yn system fodel ardderchog ar gyfer astudio esblygiad parasitiaeth mewn planhigion a'r addasiadau ffenoteipaidd a genetig gwaelodol (Westwood et al., 2010, Wickett et al., 2011). Maent hefyd yn enghraifft o sut mae data moleciwlaidd wedi gwella ein dealltwriaeth o berthnasoedd ffylogenetig yn llwyddiannus. Yn seiliedig ar astudiaethau moleciwlaidd, mae'r amgylchiad teuluol wedi newid yn sylweddol ac mae perthnasoedd rhynggenerig wedi'u haddasu (Wolfe et al., 2005; Bennett a Mathews, 2006; Park et al., 2008; McNeal et al., 2013; Fu et al., 2017; Li et al., 2019). Mae'r dadansoddiadau ffylogenetig ehangaf a mwyaf cynhwysfawr o'r Orobanchaceae hyd yma gan McNeal et al. (2013), a ddefnyddiodd set ddata gyfunol o bum marciwr (niwclear: ITS, PHYA, PHYB; plastid: matK a rps2) yn cynnwys mwy na 50 genera o'r teulu. Er gwaethaf y cynnydd hwn, nid yw llawer o genera wedi'u cynnwys mewn astudiaethau moleciwlaidd ac maent yn dal heb eu lleoli (Schneeweiss, 2013). Yn ogystal, mae perthnasoedd ffylogenetig o fewn genera, yn enwedig mewn grwpiau parasitig anffotosynthetig anodd eu tacsonomaidd, yn parhau i gael eu harchwilio'n wael.

Grŵp sydd angen ymchwiliad ffylogenetig mwy trylwyr yw'r genws gwraidd-barasitig nad yw'n ffotosynthetig.Cistanche. Mae’n wrthrych a allai fod yn werth chweil ar gyfer astudio esblygiad genomau mawr (cromosomau llawer mwy ac yn gyfatebol maint genom llawer mwy nag mewn llinachau cysylltiedig agos: Schneeweiss et al., 2004b; Weiss-Schneeweiss et al., 2006; Wicke, 2013), esblygiad gostyngol o genomau plastid (Li et al., 2013; Wicke et al., 2013, 2016; Liu et al., 2020), neu amrywiaeth rhywogaethau a bioddaearyddiaeth mewn rhanbarthau cras, ond mae unrhyw un o'r llwybrau ymchwil hyn yn cael ei rwystro ar hyn o bryd gan wael dealltwriaeth o berthnasoedd rhywogaethau oherwydd diffyg data ffylogenetig trylwyr. Mae’r ychydig astudiaethau sy’n cynnwys Cistanche yn canolbwyntio ar esblygiad y genom plastid (Li et al., 2013; Wicke et al., 2013, 2016) neu’r berthynas rhwng rhywogaethau a ddefnyddir mewn meddygaeth Tsieineaidd draddodiadol (Tomari et al., 2002, 2003 ; Han et al., 2010; Sun et al., 2012; Zheng et al., 2014), ac maent yn gyfyngedig iawn yn dacsonomegol. Yn yr un modd, mae astudiaethau ffylogenetig a gyfeiriwyd at y lefel deuluol neu sy'n canolbwyntio ar genera cysylltiedig, megis Orobanche, yn cynnwys dim ond un neu ychydig o gynrychiolwyr oCistanche(Young et al., 1999; Schneeweiss et al., 2004a; Wolfe et al., 2005; Park et al., 2008; McNeal et al., 2013; Schneeweiss, 2013; Li et al., 20197). Mae eu canlyniadau yn dangos hynnyCistancheyn perthyn yn agos i genynnau parasitig eraill nad ydynt yn ffotosynthetig, megis Orobanche, Phelipanche, Conopholis, neu Epifagus (clade III o McNeal et al., 2013; Orobanche-Phelipanche clade o Schneeweiss, 2013), ond ni fu ei union leoliad ffylogenetig wedi setlo'n llawn (Schneeweiss, 2013).

Mae'r monograff diweddaraf o'r genws cyfan gan Beck-Mannagetta (1930). Yn seiliedig ar siâp calyx a rhif bracteole, roedd yn gwahaniaethu rhwng pedair adran: (i) C. sect.Cistanchellagyda'r rhywogaeth sengl C. ridgewayana; (ii) C. sect. Sylwedd gyda'r rhywogaeth senglCistancheSinensis; (iii) C. sect. Heterocalyx, gyda thair rhywogaeth (C. fissa, C. ambigua, a C. rosea); (iv) C. sect.Cistanche(sect enwol a enwir yn anghywir. Eucistanche gan Beck Mannagetta, 1930) yn cynnwys y 12 rhywogaeth arall. Mae triniaethau tacsonomig diweddarach, fel arfer yng nghyd-destun fflora cenedlaethol, yn ychwanegu ychydig o rywogaethau newydd ac yn addasu'n rhannol amgylchiad rhywogaethau sy'n aml yn amrywio'n forffolegol ac felly'n gymhleth yn tacsonomaidd sydd eisoes wedi'u cydnabod gan BeckMannagetta (1930) fel bod tua 26 o rywogaethau'n cael eu derbyn ar hyn o bryd (Y Rhestr Planhigion, http://www.theplantlist.org , a aseswyd ar 6. Rhagfyr 2017). Mae'r genws wedi'i ddosbarthu'n eang mewn rhanbarthau cras o'r Hen Fyd o'r ynysoedd Macaronesaidd a gorllewin Affrica i ganolbarth a dwyrain Asia, gyda chanolfan yr amrywiaeth rhywogaethau uchaf yn ne-orllewin Asia a'r Dwyrain Canol (Beck-Mannagetta, 1930). Fel genera eraill nad ydynt yn ffotosynthetig o Orobanchaceae, nodweddir Cistanche gan leihad morffolegol, yn enwedig cymeriadau llystyfol (Rodrigues et al., 2011; Schneeweiss, 2013), fel bod y mwyafrif o gymeriadau diagnostig yn dod o'r inflorescence a'r blodau (siâp ac indumentum blodau bracts a bracteoles, strwythur ac indumentum y calyx, lliw blodau, siâp ac indumentum yr anther), rhai ohonynt wedi'u cadw'n wael ar sbesimenau llysieufa. Mae diffyg triniaeth dacsonomig gynhwysfawr sy'n cwmpasu'r holl rywogaethau a gydnabyddir ar hyn o bryd, cynrychiolaeth wael mewn casgliadau yn enwedig o ardaloedd llai archwiliedig, a phrinder cymeriadau morffolegol tacsonomaidd defnyddiol yn cyfrannu at dacsonomeg anhysbys a heb ei chyfuno'n ddigonol.Cistancherhywogaeth.

Yn yr astudiaeth hon, rydym yn sefydlu perthnasoedd ffylogenetig o fewnCistanchefel sail i system dacsonomig ragfynegol ffylogenetig. I'r perwyl hwn, rydym yn casglu data dilyniant o farcwyr plastid sy'n datblygu'n gyflym ac sydd wedi'u hen sefydlu yn ogystal â dilyniannau ITS niwclear o samplu tacsonomaidd a daearyddol gynhwysfawr ac yn dadansoddi'r rheini gan ddefnyddio'r parsimony mwyaf, y tebygolrwydd mwyaf, a dulliau Bayesaidd. Yn benodol, rydym am (i) rhoi prawf ar ddamcaniaethau perthnasoedd a awgrymir gan ddosbarthiad Beck-Mannagetta (1930), hy a yw ei adrannau yn cynnwys grwpiau monoffyletig, a (ii) profi a yw rhywogaethau morffolegol a thacsonomaidd gymhleth fel C. phelypaea a C. ■ tubulosa yn ffurfio grwpiau naturiol.

2. Deunyddiau a dulliau

2.1. Deunydd planhigion

Cafodd cant wyth deg naw o samplau (deunydd llysieufa newydd eu casglu neu ddilyniannau o GenBank) eu cynnwys, yn cyfateb i 17 a nodwyd yn flaenorolCistancherhywogaethau ynghyd â saith tacsa allanol (un derbyniad o Conopholis Americana, Phelipanche cf. Iberica, dau dderbyniad o Orobanche cernua, un yr un o O. anatolica, O. densiflora ac O. Transcaucasia). Mae samplu oCistanchewedi'i anelu at gwmpas daearyddol eang ar gyfer pob rhywogaeth yn y genws. Roedd adnabod rhywogaethau yn seiliedig ar y tacsonomeg a ddefnyddiwyd mewn triniaethau monograffig ac mewn fflora (Beck Mannagetta, 1930; Zhang a Tzvelev, 1998), yn dynodi mathau sy'n gwyro'n forffolegol fel affinis rhywogaeth ("aff. enw rhywogaeth") neu, lle mae'r disgrifiad o un newydd rhagwelir isrywogaeth (mae triniaeth dacsonomig o'r genws cyfan yn cael ei pharatoi), fel "subsp. nov."; ar gyfer samplau o GenBank, na allem wirio'r talebau llysieufa ar eu cyfer, cadwyd y dynodiad tacsonomig a ddefnyddiwyd gan yr awduron gwreiddiol. Dewiswyd y tacsa grŵp allanol yn unol â'n gwybodaeth gyfredol am berthnasoedd o fewn Orobanchaceae (Schneeweiss et al., 2004a; McNeal et al., 2013; Schneeweiss, 2013). Rhoddir gwybodaeth am leoliad a thalebau gan gynnwys niferoedd derbyn GenBank yn Nhabl Atodol S1.

image

2.2. ynysu a dilyniannu DNA

Roedd echdynnu DNA genomig o feinwe corolla sych-gel silica a gasglwyd yn ddiweddar yn dilyn y protocol CTAB (Doyle a Doyle, 1987). Cafodd y rhan fwyaf o ddeunydd llysieufa ei ynysu naill ai gan ddefnyddio Pecyn Bach DNeasy Plant (Qiagen, Hilden, yr Almaen) neu NucleoSpin Plant II (Macherey-Nagel, Düren, yr Almaen). homogenized tua 50 mg o ddeunydd sych gan ddefnyddio melin gymysgu (Retsch MM200, Haan, yr Almaen) ar 30 Hz am 3 munud ac yna deori mewn byffer echdynnu 700 ul am o leiaf un awr ar 65 gradd. Wedi hynny, defnyddiwyd y protocol CTAB neu'r protocolau a ddarparwyd gan y gwneuthurwyr cit.

Storiwyd DNA genomig ar −80 gradd a defnyddiwyd gwanediadau ar gyfer mwyhau yn ddiweddarach. Tri marciwr plastid (trnL-F, gan gynnwys yr intron trnL a'r gofodwr rhynggenig (IGS), trnS-FM IGS a psbA-trnH IGS), a leolir yn rhanbarth un copi mawr (LSC) y genom plastid, a'r niwclear dewiswyd bylchau mewnol trawsgrifiedig (ITS1 ac ITS2 ynghyd â'r genyn rDNA 5.8S rhyngol) ar gyfer casgliadau ffylogenetig. Dangoswyd dro ar ôl tro bod y marcwyr plastid yn addas iawn ar gyfer astudiaethau ffylogenetig ar lefel rhywogaeth (Borsch a Quandt, 2009). Yn ogystal, mae psbA-trnH eisoes wedi'i ddefnyddio ar gyfer codau bar DNA o TsieinëegCistanchetaxa (Han et al., 2010; Sun et al., 2012; Zheng et al., 2014). Dewiswyd y rhanbarth ITS niwclear fel marciwr niwclear y gellir ei drin yn dechnegol sydd, er gwaethaf nifer o broblemau posibl (Álvarez a Wendel, 2003) wedi'i gymhwyso'n llwyddiannus mewn nifer o astudiaethau ffylogenetig gyda ffocws ar berthnasoedd rhywogaethau (Baldwin et al., 1995; Álvarez a Wendel , 2003; Bailey et al., 2003) gan gynnwys Orobanche a genera cysylltiedig (ee, Schneeweiss et al., 2004a; McNeal et al., 2013). Ar ben hynny, mae ITS2 hefyd wedi'i ddefnyddio ar gyfer codio bar DNA i mewnCistanche(Han et al., 2010; Sun et al., 2012; Zheng et al., 2014; Wang et al., 2018). Mwyhawyd y rhanbarth trnL-F gan ddefnyddio'r paent preimio C ac F (Taberlet et al. 1991). Mewn rhai achosion, megis ar gyfer deunydd hen a diraddiedig yn ôl y sôn, chwyddwyd y rhanbarth mewn dau ddarn ar wahân, hy gan ddefnyddio pâr preimio C a D (Taberlet et al., 1991) a phâr preimio trnL460F (Worberg et al., 2007) a F (Taberlet et al., 1991), yn y drefn honno. Mwyhawyd yr IGS trnS-trnfM gan ddefnyddio trnS(UAG)-pF1 (5′- ACTATACCGGTTTTCA AGGCC-3′) a trnfM(CAU)-pR1 (5′-TAG AGC AGTTTGGTAGCTCGCA-3′ S. , Münster, pers. comm.), yr IGS psbAtrnH gan ddefnyddio paent preimio Kress et al. (2005). Roedd y proffil PCR ar gyfer y marcwyr plastid yn cynnwys cam dadnatureiddio cychwynnol o 5 munud ar 94 gradd, wedi'i ddilyn gan 30 cylch yr un gydag 1 munud ar 94 gradd, 1 munud ar 55 gradd, 90 s ar 72 gradd, a cham ehangiad terfynol o 7 min ar 72 gradd. Ymhelaethwyd ar y rhanbarth ITS gan ddefnyddio'r paent preimio ITS4 ac ITS5 (White et al., 1990) gyda phroffil ymhelaethu o 5 munud ar 94 gradd ac yna 40 cylch yr un gydag 1 munud ar 94 gradd, 1 munud ar 48 gradd gydag amser- cynyddiad o plws 4 s y cylch, 45 s ar 68 gradd, a cham ymestyn terfynol o 7 munud ar 68 gradd . Ailadroddwyd PCRs aflwyddiannus gan ddefnyddio paent preimio mewnol 5.8S106-R (5′- AGGCGCA ACTTGCGTTCAAA -3′) a 5.8S32-F (5′-GCATCGATGAAGAACGT AGC-3′; D. l. Nickrent, Prifysgol De Illinois, UDA, pers. comm.) mewn cyfuniad â'r paent preimio allanol perthnasol ITS5 ac ITS4. Perfformiwyd adweithiau PCR mewn cyfaint o 25 ul ac roedd yn cynnwys 1.5 UGoTaq Flexi DNA polymerase (Promega, Madison, UDA), 0-0.2 M betaine monohydrate, 0.4 µM o bob preimiwr blaen a gwrthdroi, 0.15 mM dNTPs (Carl Roth, Karlsruhe, Yr Almaen), 1 mM MgCl2 mewn byffer Flexi 1xGoTaq, DNA genomig 1 ul o grynodiad anhysbys, a dŵr. Ar gyfer peth deunydd llysieufa diraddiedig iawn, defnyddiwyd Ready-To-Go PCRBeads (Amersham-Pharmacia Biotech, Amersham, UK) yn dilyn cyfarwyddiadau'r gwneuthurwr. Fel sy'n ofynnol yn gyffredin ar gyfer ynysu DNA o ddeunydd llysieufa, ychwanegwyd ychwanegion PCR fel 1 ul PVP-40 (10–40 y cant) a/neu hydoddiant gwella 5 ul P (5 ×; PeqLab, Erlangen, yr Almaen) at yr adweithiau ar draul dwr. Cafodd cynhyrchion ymhelaethu eu puro â gel ar gel agarose 1 y cant gan ddefnyddio pecyn puro PCR thePeqLab (Peqlab) neu'r pecyn puro PCR cyflym (Qiagen). Ar gyfer cynhyrchion ITS-PCR nythu o < 300="" bp="" (ymhelaethiad="" o="" ddeunydd="" llysieufa,="" sydd="" yn="" aml="" wedi'i="" halogi="" â="" ffyngau),="" dewiswyd="" crynodiad="" gel="" uwch="" (1.4="" y="" cant)="" ac="" amseroedd="" rhedeg="" hirach.="" cafodd="" cynhyrchion="" pcr="" wedi'u="" glanhau="" eu="" dilyniannu="" gan="" macrogen="" (seoul,="" korea)="" gyda'r="" paent="" preimio="" ymhelaethu="" a'r="" paent="" preimio="" mewnol="" ychwanegol="" a="" grybwyllwyd="" uchod,="" lle="" bo="">

cistanche tubulosa

cistanche wirkung


2.3. Aliniad dilyniant, codio indel, a dadansoddiadau ffylogenetig

Cafodd dilyniannau DNA eu cydosod a'u halinio gan ddefnyddio PhyDE 0.97 (Müller et al., 2006). Yn dilyn Olsson et al. (2009), anodiwyd rhanbarthau o homoleg ansicr (mannau problemus treiglo) yn PhyDE a'u tynnu o'r dadansoddiadau. Roedd gwrthdroadau wedi’u hynysu’n safleol yn yr aliniad ac wedi’u cynnwys fel gwrthdro ategu fel yr awgrymwyd yn flaenorol (Quandt et al., 2003; Borsch a Quandt; 2009). Cafodd indels eu codio gan ddefnyddio codio indel syml (SIC; Simmons ac Ochoterena, 2000) fel y'i gweithredwyd yn SeqState 1.25 (Müller, 2005) a'i ychwanegu fel rhaniad data ychwanegol. Ym mhob matrics data, cafodd bylchau dilyniant eu trin fel data coll a chafodd safleoedd wedi'u halinio eu trin yn gyfartal.

Cynhaliwyd dadansoddiadau ar dair set ddata dilyniant yn cyfateb i farcwyr plastid cydgadwynedig, ITS, a data cyfun (marcwyr plastid a niwclear wedi'u cyfuno), pob un â indels neu hebddynt, gan arwain at ddadansoddi cyfanswm o chwe set ddata. Cyn y dadansoddiadau cyfunol, cafodd setiau data marciwr sengl eu sgrinio am anghysondebau ymhlith marcwyr trwy ddadansoddiad ar wahân o bob locws unigol yn MrBayes gan ddefnyddio'r gosodiadau diofyn (data heb ei ddangos). Perfformiwyd y dadansoddiadau parsimony mwyaf (MP) o'r matrics niwcleotid cydgadwynedig gyda'r matrics indel atodedig a hebddo yn PAUP* 4.0b10 (Swofford, 1999) gan ddefnyddio'r glicied parsimony (Nixon, 1999) trwy'r ffeiliau gorchymyn a gynhyrchwyd gan PRAP2 (Müller, 2004). Defnyddiwyd y gosodiadau clicied canlynol: 200 iteriad gyda 25 y cant o'r safleoedd wedi'u pwysoli i fyny ar hap (pwysau=2) ym mhob atgynhyrchiad a 10 cylch adio ar hap. Dadansoddiadau tebygolrwydd mwyaf (ML) o'r matrics niwcleotid cydgadwyn

gyda'r matrics indel atodedig a hebddo, wedi'u cynnal gan ddefnyddio RAxML 8 (Stamatakis, 2014) gan ddefnyddio'r model GTRCAT. Ar gyfer dadansoddiadau MP ac ML, amcangyfrifwyd cefnogaeth trwy bootstrapping (Felsenstein, 1985) gan ddefnyddio copïau 10,000. Perfformiwyd casgliadau Bayesaidd (BI), a gynhaliwyd ar bob un o'r chwe set ddata (marcwyr sengl a chydgadwynedig, gyda chod indels a hebddynt) gyda MrBayes 3.2.2 (Huelsenbeck a Ronquist, 2001; Ronquist a Huelsenbeck, 2003) yn cyflogi'r GTR plus Γ plus I model ar gyfer y rhaniad niwcleotid (dau fodel heb eu cysylltu rhag ofn y set ddata gyfunol) a'r model safle cyfyngu (F81-like; Felsenstein, 1981) ar gyfer y rhaniad indel gyda priors diofyn. Roedd chwe rhediad gyda 10 miliwn o genedlaethau'r un a phedair cadwyn yr un (un cadwyn oer a thair cadwyn wedi'i chynhesu gan ddefnyddio'r gwresogi rhagosodedig) yn rhedeg yn gyfochrog, gan samplu pob 1000fed cenhedlaeth. Cafodd y 25 y cant cyntaf eu taflu fel llosgi i mewn, a oedd ymhell ar ôl i gadwyni gyrraedd llonyddwch, fel y nodwyd yn Tracer v.1.7.1 (Rambaut et al., 2018). Golygwyd coed gan ddefnyddio TreeGraph2 (Stöver a Müller, 2010).

3. Canlyniadau

Rhoddir nodweddion y set ddata lawn, lle na chafodd unrhyw safleoedd eu dileu, a'r set ddata, lle mae mannau problemus (am fanylion y rhai gweler Tabl Atodol S2) wedi'u tynnu (ailadroddiadau mononucleotid) neu eu dychwelyd (gwrthdroadau sy'n gysylltiedig â phin gwallt), yn Nhabl. 1. Roedd y rhan fwyaf o indels yn y set ddata yn ailddarllediadau o ddarnau cyfagos (hy, ailadroddiadau dilyniant syml [SSR]), yn amrywio o ran hyd o 2 i 20 niwcleotidau (data heb ei ddangos). Yn ogystal, yn y spacer psbA-trnH, gwelwyd dileu 1148 bp yn y matrics wedi'i alinio yn C. aff. fissa 2, sy'n cyfateb i ostyngiad yn hyd dilyniant i 20 y cant o'r hyd cyfartalog.

Ni welsom unrhyw anghysondebau sylweddol ymhlith perthnasoedd ffylogenetig a gasglwyd o farcwyr plastid sengl (data heb ei ddangos), ond rhwng marcwyr plastid cydgadwynedig a'r marciwr niwclear (Ffigs Atodol. S1-S2). Roedd y rhain i'w cael yn bennaf yn y clâd gan gynnwys, ymhlith eraill, C. phelypaea aCistanchetubulosa (hy, y Clade Eang: gweler y paragraff nesaf), a nodweddwyd gan lefel gyffredinol bas o wahaniaeth (gweler ffylogram yn Ffig. 1). Nid oedd unrhyw anghysondebau sylweddol rhwng coed a gasglwyd o setiau data gyda indels codio neu hebddynt; fodd bynnag, gan ddefnyddio gwybodaeth indel cynyddodd y datrysiad topolegol cyffredinol, tra bod ei effaith ar werthoedd cymorth yn amwys (Ffig. 1, Ffigys Atodol. S1-S3).

image

image

Y coed ffylogenetig a gafwyd o ML a BI yn seiliedig ar farcwyr plastid a niwclear cyfun, gyda indels (sgôr tebygrwydd log ML o −21272.719; cymedr harmonig sgoriau tebygrwydd boncyff o BI o −21432.751) a heb indels (tebygolrwydd log ML sgôr o −17135.239; harmonig cymedr o log-tebygolrwydd sgoriau o BI o −17654.075), yn gryf cyfath a esgor ar goeden wedi'i datrys yn dda (Ffig. 1). Yn y canlynol, byddwn yn canolbwyntio ar ganlyniadau'r dadansoddiadau cyfun, gan gyfeirio at ddadansoddiadau un marciwr (plastid cydgadwynedig yn erbyn niwclear) dim ond rhag ofn y bydd anghysondebau sylweddol. Y dadansoddiadau cyfun a nodwydCistanchefel grŵp monoffyletig, er mai dim ond yn cael ei gefnogi'n wan (ML 61/ < 50;="" bi="" 0.77/0.91;="" gwerthoedd="" cynnal="" o="" ddadansoddiadau="" gydag="" indels="" wedi'u="" codio/heb="" indels="" wedi'u="" codio).="" mewn="" dadansoddiad="" as,="" sefyllfa="" c.="" sinensis="" mewn="" perthynas="" ag="">Cistancherhywogaethau a'r tacsa outgroup ei ddatrys (Atodol Ffig. S3).Cistanchesyrthiodd yn bedwar cladin mawr â chefnogaeth dda (Ffig. 1, Ffig Atodol. S3), y cyfeirir ato o hyn ymlaen fel Clade Dwyrain Asia, Clade De-orllewin Asia, Clade Gogledd-orllewin Affrica, a Clade Eang, yn y drefn honno. Tybiwyd bod y Clade dwyrain-Asiaidd, sy'n cynnwys C. Sinensis yn unig (MP 100/100; ML 100/100; BI1.00/1.00) o Tsieina a Mongolia, yn chwaer i'r gweddill oCistanche(MP 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00). Roedd Clade De-orllewin Asia (MP 1{00/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00), yn cynnwys sawl rhywogaeth o dde-orllewin i ganolbarth Asia, yn chwaer i'r clade (AS 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00) gan gynnwys Clade gogledd-orllewin Affrica a'r Clade Eang. Tra bod Clade gogledd-orllewin Affrica (MP 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00) yn cynnwys un rhywogaeth yn unig wedi'i chyfyngu i ogledd-orllewin Affrica, roedd y Clade eang (MP 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00) yn cynnwys tua deg rhywogaeth ar y cyd â dosbarthiad eang o arfordiroedd Iwerydd Ewrop ac Affrica i ganolbarth Asia.

Yn y Clade De-orllewin Asia, mae'r strwythur ffylogenetig yn amlwg (Ffig. 1, Atodol Ffig. S3). Clade A (MP 98/100; ML 100/ 100; BI 1.00/1.00) yn cynnwys C. ambigua yn unig, a oedd yn perthyn i ddau is-glân ar wahân yn ddaearyddol, un (MP 79/1{{30}}; ML 75/ < 50;="" bi="" 1.00="">< 50)="" yn="" cynnwys="" derbyniadau="" o="" ogledd-ddwyrain="" iran="" yn="" unig,="" yr="" ail="" (mp="" 75/51;="" ml="" 82/="">< 50;="" bi="" 1.00/{{0).="" 51)="" gyda="" rhai="" derbyniadau="" o="" ogledd="" iran="" yn="" ogystal="" â="" dau="" dderbyniad="" o="" dde-orllewin="" afghanistan.="" roedd="" clade="" a="" yn="" chwaer="" (as="" 70/52;="" ml="" 69/="">< 50;="" bi="" 1.00/0.93)="" i="" c.="" ridgewayana="" o="" afghanistan.="" chwaer-grŵp="" dilynol="" (mp="" 98/="" 99;="" ml="" 100/100;="" bi="" 1.00/1.00)="" wedi'i="" orchuddio="" â="" b="" (mp="" 62/68="" ;="" ml="" 75/79;="" bi="" 0.97/1.00)="" yn="" cynnwys="" derbyniadau="" c.="" aff.="" cefnffordd.="" o="" fewn="" clade="" b="" strwythur="" ffylogenetig="" cyfateb="" i="" ddaearyddiaeth,="" oherwydd="" derbyniadau="" o="" ogledd-orllewin="" a="" chanol="" iran="" (aff.="" ridgewayana="" 2)="" ffurfio="" subclade="" nythu="" o="" fewn="" gradd="" o="" derbyniadau="" o="" ganolog="" yn="" bennaf="" a="" deheuol="" iran="" (aff.="" ridgewayana="" 1).="" roedd="" y="" berthynas="" rhwng="" derbyniadau="" c.="" ridgewayana="" sl="" (c.="" ridgewayana="" a="" c.="" aff.="" ridgewayana)="" yn="" wahanol,="" fodd="" bynnag,="" ymhlith="" y="" marcwyr:="" er="" bod="" c.="" ridgewayana="" sl="" yn="" cael="" ei="" gasglu="" fel="" monoffyletig="" heb="" unrhyw="" strwythur="" mewnol="" a="" gefnogir="" gan="" ddata="" its="" (ffig="" atodol.="" s2)="" ,="" fe'i="" casglwyd="" fel="" paraffyletig="" gan="" ddata="" plastid="" gyda,="" o'i="" gymharu="" â'r="" dadansoddiad="" cyfunol,="" safleoedd="" newid="" c.="" aff.="" ridgewayana="" 1="" a="" c.="" aff.="" ridgewayana="" 2.="" mae'r="" chwaer="" grŵp="" dilynol="" i'r="" clâd="" yn="" cynnwys="" c.="" ambigua="" a="" c.="" ridgewayana="" sl="" (mp="" 74/60;="" ml="" 96/93;="" bi="" 1.00/1.00)="" oedd="" clad="" c="" (mp="" 100/100;="" ml="" 100/100;="" bi="" 1.00/1.00)="" yn="" cynnwys="" c.="" aff.="" fissa="" 1="" o="" afghanistan.="" y="" chwaer-grwpiau="" dilynol="" oedd="" (i)="" esgyniad="" sengl="" c.="" aff.="" fissa="" 2="" o="" azerbaijan="" (as="" 57/100;="" ml="" 84/85;="" bi="" 0.88/0.57),="" (ii)="" clade="" d="" (mp="" 100/100;="" ml="" 100/100;="" bi="" 1.00/1.00)="" yn="" cynnwys="" c.="" salsa="" o="" dde-orllewin="" asia="" a="" o="" tsieina="" (as="" 100/100;="" ml="" 80/90;="" bi="" 0.99/0.99),="" a="" (iii)="" clade="" e="" (mp="" 100/100;="" ml="" 100/100;="" bi="" 1.00/="" 1.00)="" yn="">Cistanchedeserticola o Tsieina a Mongolia (AS 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00).

image

Ffig. 2. Blodau nodweddiadol a siapiau calyx ar gyfer aelodau dethol o'r Clade Dwyrain Asia (J), Clad De-orllewin Asia (F-I), Clad Gogledd-orllewin Affrica (K), a'r Clad Eang (A-E, L - M) o Cistanche. (A) C. senegalensis, (B) C. flava, (C) C. tubulosa subsp. tubulosa, (D) C. fiolacea, (E) C. phelypaea subsp. tach., (F) C. fissa, (G) C. salsa, (H) C. ridgewayana, (I) C. ambigua, (J) C. Sinensis, (K) C. spec. tach., (L) C. rosea, (M) C. laxiflora.

Yn y Clade Eang roedd perthnasoedd weithiau'n amwys oherwydd cydraniad isel y data niwclear yn ogystal ag anghysondebau rhwng marcwyr plastid a niwclear (Ffigau Atodol. S1-S2). Roedd y rhain yn ymwneud nid yn unig â sefyllfa derbyniadau sengl (ee, C. Senegalese ED1096,Cistanchesubsp tubulosa. tubulosa ED891) ond hefyd yr amgylchiad o isgladau mwy. Er enghraifft, tra bod data plastid yn casglu C. Rosea fel chwaer â chefnogaeth dda i'r rhywogaeth sy'n weddill (BI 1. 00; Ffig Atodol S1), roedd data niwclear yn awgrymu ei fod yn aelod o glâd (BI 1. 00) gan gynnwys pob rhywogaeth ac eithrio C. phelypaea, C. violacea, a'r rhan fwyaf o dderbyniadau C. lutea (Ffig Atodol S2). O ganlyniad, roedd perthnasoedd ymhlith cladinau mawr (clades F-J) a gasglwyd o'r dadansoddiadau cyfunol yn aml wedi'u datrys yn wael ac yn cael eu cefnogi'n wael (Ffig. 1). Yr unig eithriad oedd clad F (MP 100/100; ML 100/100; BI 1.00/1.00), yn cynnwys C. rosea o'r Penrhyn Arabia (yn y dadansoddiad ITS, roedd y clâd cyfatebol a'r unig gefnogaeth wan hefyd yn cynnwys derbyn ED1096 o C. senegalensis: Ffig Atodol S2), y mae ei chwaer-grŵp perthynas â'r clâd (AS 99/94; ML 98/99; PP 1.00/ 0.99) yn cynnwys y rhywogaethau oedd yn weddill (clades G–J; Ffig. 1) yn cael ei gefnogi'n dda.

cistanche tubulosa

cistanches llysieuol


Roedd Clade G (MP 63/99; ML 84/54; BI 1.00/ < 5{0)="" yn="" cynnwys="" c.="" laxiflora="" o="" iran="" ac="" affganistan="" ynghyd="" â="" dau="" dderbyniad="" o="" diwbiau="" c.="" o="" tsieina="" (gb1="" a="" gb2).="" o="" fewn="" clâd="" g,="" roedd="" c.="" laxiflora="" yn="" baraffyletig,="" oherwydd="" bod="" is-gladet="" y="" ddau="" dderbyniad="" c.="" tubulosa="" (mp="" 98/65;="" ml="" 99/73;="" bi="" 1.00/{{0.77)="" wedi'u="" grwpio="" yn="" clâd="" (mp="" 54/="">< 50;="" ml="" 60/91;="" bi="" 1.00/1.00)="" gyda="" derbyniadau="" c.="" laxiflora="" o="" ogledd="" a="" de="" iran="" yn="" ogystal="" â="" afghanistan="" (as="" 85/="">< 50;="" ml="">< 50/50;="" bi="">< 0.50/0.74)="" i="" eithrio="" derbyniadau="" c.="" laxiflora="" o="" ganol="" iran="" gan="" ffurfio="" clâd="" ar="" wahân="" (mp="" 99/95;="" ml="" 99/95;="" bi="" 1.="">

Roedd Clade H (MP heb ei gefnogi; ML 97/50; PP 1.00/ < 50)="" yn="" cynnwys="" c.="" senegalensis="" (dwyrain="" affrica)="" ac,="" yn="" nythu="" ynddo,="" monoffyletig,="" eto="" heb="" ei="" gefnogi,="" c.="" flava="" (de-orllewin="" asia)="" ac="" is-clad="" (mp="" 90/73;="" ml="" 86/69;="" bi="" 0.79/0.86)="" yn="" cynnwys="" derbyniadau="" o="" c.="" aff.="" tubulosa="" o="" dde="" penrhyn="" arabia="" (oman,="" yemen).="" daeth="" tystiolaeth="" ar="" gyfer="" clade="" h="" yn="" ei="" hanfod="" o="" ddata="" plastid="" yn="" unig="" oherwydd="" yn="" its="" c.="" tybiwyd="" bod="" flava="" yn="" perthyn="" yn="" agos="" i="" c.="" laxiflora="" ac="" roedd="" perthnasoedd="" ymhlith="" c.="" senegalensis="" a="" c.="" tubulosa="" yn="" parhau="" i="" fod="" heb="" eu="" datrys="" (ffig="" atodol="" s2).="" yn="" clade="" h,="" nid="" yn="" unig="" yr="" oedd="" perthnasoedd="" o="" c.="" tubulosa="" a="" c.="" flava="" i="" c.="" senegalensis="" wedi'u="" datrys="" yn="" wael="" a'u="" cefnogi'n="" wael,="" ond="" hefyd="" y="" rhai="" ymhlith="" llinachau="" o="" fewn="" c.="" senegalensis="" ac="" o="" fewn="" c.="" flava,="" a'r="" unig="" eithriad="" oedd="" is-glad="" o="" bedwar="" c.="" •="" derbyniadau="" flava="" (flava="" subsp.="" nov.)="" o="" ogledd="" iran="" (as="" 100/97;="" ml="" 100/99;="" bi="">

Roedd Clade I (AS heb ei gefnogi; ML 62/54; PP 1.00/ < 0.50)="" yn="" cynnwys="" derbyniadau="" o="" c.="" tubulosa="" yn="" unig,="" yn="" cwmpasu="" ystod="" ddaearyddol="" eang="" o="" ynysoedd="" cape="" verde="" a="" mali="" trwy="" penrhyn="" arabia="" ac="" iran="" i="" bacistan="" ac="" india.="" daeth="" tystiolaeth="" ar="" gyfer="" clade="" h="" hefyd="" yn="" ei="" hanfod="" o="" ddata="" plastid="" yn="" unig,="" oherwydd="" yn="" its="" dyfarnwyd="" bod="" y="" grŵp="" hwn="" yn="" baraffyletig="" ac="" yn="" aml="" heb="" ei="" ddatrys="" mewn="" perthynas="" â="" c.="" rosea="" (clade="" f),="" c.laxiflora="" (clad="" g)="" yn="" ogystal="" â="" c.="" senegalensis="" a="" c="" .fflafa="" (clade="" h).="" roedd="" adeiledd="" ffylogenetig="" yng="" nghlad="" i="" yn="" wan="" ar="" y="" cyfan="" ac="" nid="" oedd="" yn="" dangos="" unrhyw="" batrwm="" daearyddol="">

Roedd Clade J (MP 92/53; ML 97/87; PP 1.00/0.99) yn cynnwys C. lutea sl (hy, gan gynnwys C. lutea, C. aff. lutea 1 a C. aff. lutea 2; Ynysoedd Macaronesaidd a Môr y Canoldir) ac, yn nythu ynddynt, C. Brunner (gorllewin Affrica), C. phelypaea (Ynysoedd Macaronesaidd, rhanbarthau arfordirol Iwerydd a Môr y Canoldir Affrica a de-orllewin Ewrop), a C. violacea ( gogledd Affrica).Cistanchephelypaea (MP 100/98; ML 100/ 100; BI 1.00/1.{{ 31}}0) wedi'i ffurfio, ynghyd â gradd C. lutea sl (derbyniadau o bob rhan o ystod dosbarthiad y rhywogaeth hon) ynghyd â dau dderbyniad C. violaceus (ED807 ac ED1{{ 41}}12 o Saudi Arabia a Jordan, yn y drefn honno) a hybrid C. aff. lutea 1 a C. fiolacea, clâd â chefnogaeth wan (MP 55/-; ML 76/67; BI 0.64/ < 0.50)="" a="" oedd="" yn="" chwaer="" (as="" 90/53;="" ml="" 97/92;="" bi="" 0.96/0.89)="" i="" gladd="" (mp="" 68/58;="" ml="" 93/82;="" bi="" 0.90/0.63)="" gan="" gynnwys="" pob="" derbyniad="" ac="" eithrio'r="" ddau="" o="" c.="" violacea.="" mewn="" cyferbyniad="" â="" c.="" violacea,="" lle="" mae="" gwahaniad="" daearyddol="" yn="" glâd="" sydd="" wedi'i="" ddosbarthu'n="" eang="" (mp="" 53/70;="" ml="" 84/85;="" bi="" 0.92/="" 0.59)="" a="" chladin="" moroco="" yn="" unig="" (mp="" 92/93;="" ml="" 99/99;="" bi="" 1="" .00/0.95),="" roedd="" strwythur="" ffylogenetig="" a="" daearyddol="" yn="" c.="" lutea="" sl="" a="" c.="" phelypaea="" yn="" gyfyngedig.="" roedd="" gweddill="" derbyniadau="" c.="" lutea="" (pob="" un="" o="" orllewin="" affrica)="" ynghyd="" â="" c.="" brunneri="" (dim="" ond="" un="" derbyniad="" wedi'i="" gynnwys)="" yn="" gyfystyr="" â="" gradd="" ar="" waelod="" clade="" j="" oherwydd="" lleoliad="" esgyniad="" c.="" lutea="" o="" niger="" (ed726)="" y="" tu="" allan="" i'r="" ardal.="" clade="" (mp="" 94/60,="" ml="" 95/69;="" bi="" 1.00/0.99)="" a="" ffurfiwyd="" gan="" y="" derbyniadau="" eraill.="" roedd="" casgliad="" o'r="" radd="" c.="" lutea="" hon="" yn="" debygol="" o="" fod="" oherwydd="" anghysondebau="" rhwng="" data="" plastid="" ac="" its.="" yn="" benodol,="" o="" ddata="" plastid,="" casglwyd="" bod="" y="" derbyniadau="" lutea="" c.="" hyn="" ynghyd="" â="" c.="" brunneri="" yn="" perthyn="" yn="" agos="" i="" c.="" violacea="" a="" derbyniadau="" lutea="" c.="" eraill="" (ffig="" atodol="" s1),="" hy,="" fel="" yn="" y="" data="" cyfunol,="" tra="" bod="" data="" its="" yn="" gosod="" y="" rheini="" ,="" mewn="" sefyllfa="" heb="" ei="" datrys,="" mewn="" clâd="" gyda="" c.="" senegalensis="" a="" c.="" tubulosa="" i="" wahardd="" aelodau="" eraill="" o="" clade="" j="" (ffig="" atodol="">

4. Trafodaeth

Yn y monograff diweddaraf o'r genwsCistanche, Roedd Beck-Mannagetta (1930) yn gwahaniaethu rhwng pedwar grŵp (fel adrannau tacsonomig) yn amrywio o ran nodweddion calyx a nifer y bracteoles. Ac eithrio'r sect C. monospecific. Substance (East Asian Clade), nid oes yr un o adrannau Beck Mannagetta yn cael eu cefnogi fel monoffyletig. Yn hytrach, rhywogaeth o C. sect.Cistanchea C. sect. Mae Heterocalyx yn gymysg (yn y Clade de-orllewin Asia a'r Clade Eang) a'r rhywogaeth unigol o C. sect. Mae Cistanchella yn baraffyletig ac wedi'i nythu yn y Clade De-orllewin Asia. Pedwerydd llinach fawr ( Clade Gogledd-orllewin Affrica), a gynrychiolir yma gan rywogaeth sydd eto i'w disgrifio sy'n morffolegol agos at C. mauritanica, a leolwyd yn draddodiadol yn y sect C.Cistanchenad yw wedi'i nodi yn unrhyw un o'r dosbarthiadau blaenorol

Gellir nodweddu'r pedair prif linach a nodir yma hefyd yn forffolegol. Yn benodol, yr unig rywogaeth o'r Clade Dwyrain Asia, C. Sinensis, yw'r unig unCistancherhywogaethau â chalyx pedrorit endoredig dwfn, tra bod gan bob un arall (o leiaf) bum llabed calyx connate yn bennaf (Ffig. 2). Mae gan rywogaethau'r Clad Eang goesynnau glabrous, bracts, a chalyces, tra bod rhai Clad De-orllewin Asia a Gogledd-orllewin Affrica o leiaf yn rhannol flewog (wlanog neu lanuginose yn erbyn arachnoid-lanuginose, yn y drefn honno) (Ffig. 2). Yn olaf, mae gan aelodau Clade Gogledd-orllewin Affrica indumentum arachnoid-lanuginose trwchus ac yn fras bracts rhomboid nas canfyddir yn y Clade De-orllewin Asia (Ffig. 2). Cymeriadau a bwysleisiwyd yn flaenorol, hy, nifer y bracteoles (un neu ddim yn C. sect.Cistanchellayn erbyn dwy ym mhob adran arall) a siâp y llabedau calyx (llabedau wedi'u gwahanu'n ddwfn fwy neu lai yn C. sect. Heterocalyx yn erbyn llabedau wedi'u gwahanu'n fas ac yn gyfartal yn C. sect.Cistanche), nid ydynt yn adlewyrchu holltau dyfnach ac, o leiaf yn achos siâp y llabedau calyx, ymddengys eu bod wedi esblygu o leiaf ddwywaith yn annibynnol.

Nid yw nifer o'r rhywogaethau a gydnabyddir ar hyn o bryd yn cael eu cefnogi fel monoffyletig (Ffig. 1), nad yw wedi'i gyfyngu i tacsa y gwyddys ei fod yn anodd yn dacsonomegol, megis C. lutea neu C. tubulosa, ond hefyd i dacson a ystyrir yn dacsonomaidd yn ddibroblem, megis C. . ridgewayana sl orCistanchefissa sl (a gynrychiolir yma gan C. aff. fissa 1 a 2). Gall yr anghysondeb rhwng unedau tacsonomig a ffylogenetig fod oherwydd nifer o ffactorau nad ydynt yn annibynnol ar ei gilydd, gan gynnwys cam-adnabod rhywogaethau, diffyg cydnabyddiaeth dacsonomig o endidau sydd wedi’u gwahaniaethu’n forffolegol a/neu’n ddaearyddol, hybrideiddio, a dargyfeiriad bas (ymbelydredd cyflym). Mae cam-adnabod rhywogaeth yn debygol o fod yn achos lleoliad dau dderbyniad o C. tubulosa (GB1 a GB2) yn nythu yn C. laxiflora (Ffig. 1). Nid oedd talebau'r derbyniadau hyn ar gael i ni eu hadolygu, ond, fel y bernir o ddelweddau gwe, mae planhigion o ardaloedd cyfagos yn anialwch canolog Tsieina yn cytuno'n forffolegol â C. laxiflora subsp. laxiflora (tiwbiau corolla gwyn gyda llabedau porffor golau yn lle melyn golau i ddwfn yn C. tubulosa). Nid yw'r rhywogaeth hon yn cael ei hadrodd o Tsieina, lle mae planhigion sy'n ymwneud â'r tacson hwn naill ai wedi'u rhestru dan C. tubulosa (Zhang, 1990) neu, yn fwy diweddar, o dan C. mongolica (Zhang a Tzvelev, 1998). Ymddengys bod diffyg cydnabyddiaeth dacsonomig o linachau gwahaniaethol morffolegol a/neu ddaearyddol yn berthnasol i rywogaethau paraffyletig, fel C. ridgewayana sl a C. aff. fissa, yn ogystal ag i rywogaethau monoffyletig â strwythur ffylogenetig cryf, megis C. Flava. Ym mhob un o'r achosion hyn, mae grwpiau sydd wedi'u hamgylchynu'n ffylogenetig yn amrywio'n forffolegol ac yn ddaearyddol ac, felly, maent yn haeddu cydnabyddiaeth dacsonomig (rhoddir triniaeth dacsonomig fanwl mewn cyhoeddiad dilynol). Mae cam-adnabod rhywogaethau a datrysiad tacsonomig annigonol yn broblemau cyffredin mewn Orobanchaceae holoparasitig, yn enwedig mewn Orobanche a genera cysylltiedig (Manen et al., 2004; Schneeweiss et al., 2004a; Schneeweiss et al., 2009; Schneeweiss et al., 2009; Schneeweiss et al., 201s).

Mae hybrideiddio yn ffenomen gyffredin mewn planhigion blodeuol (Rieseberg a Carney, 1998; Payseur a Rieseberg, 2016) ac adroddwyd hefyd ar gyferCistanche. Yn benodol, disgrifiodd Beck-Mannagetta (1930) hybridiau rhwng C. lutea (fel C. tinctoria f. lutea) a C. violacea fel nothospecies, C. hybrid. Gall yr hybridau hyn fod yn forffolegol ganolraddol, fel sy'n wir ar gyfer derbyn ED686, neu gallant fod yn debyg i un o'r rhieni, fel sy'n wir am esgyniad ED1012; mae'r esgyniad olaf hwn wedi'i bennu'n wreiddiol fel C. violacea, ond ar ôl cael ei ail-archwilio, wedi'i ysgogi gan ei safle ffylogenetig o fewn C. lutea sl, trodd allan i fod yn hybrid hefyd. Gan dybio etifeddiaeth mamol o'r genom plastid (fel y dangosir ar gyfer yr Orobanchaceae Rhinanthus angustifolius: Vrancken a Wesselingh, 2010) ynCistanche, byddai presenoldeb riboteip ITS y fam yn y derbyniad hybrid ED686 (nid yw ar gael ar gyfer derbyn ED1012) yn gyson â ffurfio hybridau cenhedlaeth ddiweddarach a/neu groesgroesau, gan arwain at ddal plastid. Gallai cipio plastid hefyd esbonio anghysondebau rhwng marcwyr niwclear a plastid. Er enghraifft, mae C. aff. tubulosa o Benrhyn Arabia, yn forffolegol wahanol mewn nifer o nodweddion o eang C. tubulosa, ffurfio clâd yn agos at C. senegalensis yn y set ddata ITS ond wedi'i wahanu'n ddau cladau gwahanol yn y plastid a'r set ddata cyfunol grwpio gyda C. senegalensis (clad H) neu dderbyniadau o C. tubulosa subsp. tubulosa (clad I; mae C. senegalensis a C. tubulosa subsp. tubulosa hefyd i'w cael ar Benrhyn Arabia).

Dewis arall yn lle mewnlifiad ar gyfer esbonio anghysondebau rhwng safleoedd ffylogenetig a gasglwyd o ddata niwclear yn erbyn data plastid yw didoli llinach anghyflawn, a fydd yn effeithio'n wahanol ar genomau niwclear a plastid yn wahanol oherwydd gwahaniaethau ym maint eu poblogaeth effeithiol (mewn genomau plastid dim ond hanner mor fawr ag mewn genomau niwclear yn grŵp monoecious megisCistanche). Disgwylir i ddidoli llinach anghyflawn fod yn arbennig o berthnasol yn achos dargyfeiriad bas ac ymbelydredd cyflym (Maddison a Knowles, 2006), sydd yn ôl pob tebyg yn wir yn y Clad Eang, lle nodweddir y clâd sy'n cynnwys Clades G i J gan hyd cangen byr. (Ffig. 1). Gall didoli llinach anghyflawn fod yn gyfrifol am ddiffyg gwahaniaethu moleciwlaidd a/neu gydlyniad llinachau gwahaniaethol morffolegol o fewn C. lutea sl (hy, C. aff. lutea 1 a C. aff. lutea 2). Bydd datgymalu didoli llinach anghyflawn a mewnlifiad yn gofyn am ddulliau sy’n seiliedig ar gyfuno (Blanco-Pastor et al., 2012) yn ddelfrydol sy’n cynnwys data ffylogenomig niwclear (Bravo et al., 2019), nad ydynt, yn absenoldeb fframwaith tacsonomig solet a data digon helaeth, yn berthnasol. bosibl eto.

Mae arbenigo gwesteiwr yn rym esblygiadol pwysig yn Orobanchaceae holoparasitig (Schneider et al., 2016).Cistanche, fodd bynnag, yn ymddangos yn eithriad, gan fod llawer o rywogaethau wedi'u canfod mewn aelodau o nifer o deuluoedd planhigion, yn fwyaf aml Amaranthaceae (gan gynnwys Chenopodiaceae) a Polygonaceae, ond hefyd Fabaceae, Zygophyllaceae, Tamaricaceae, Rosaceae, Nitrariaceae, a Salvadoraceae. Fel yn Orobanche (Manen et al., 2004), efallai y bydd yr un gwesteiwr yn cael ei rannu gan sawl un nad yw'n perthynCistancherhywogaeth (ee, Haloxylon ammodendron yw'r lletywr ar gyfer C. deserticola o'r Clade De-orllewin Asia ac ar gyfer C. phelypaea o'r Clade Eang). Gall achosion o arbenigo gwesteiwr tybiedig (ee, C. senegalensis yn bennaf ar Acacia/Fabaceae; yn bennaf Fabaceae fel gwesteiwyr ar gyfer C. Flava subsp. tach. yn erbyn Calligonum bungei/Polygonaceae yn bennaf ar gyfer C. Flava subsp. Flava) adlewyrchu digonedd y gwesteiwr addas rhywogaethau yn hytrach nag arbenigedd gwesteiwr gwirioneddol. Bydd profi unrhyw rôl sydd gan arbenigo gwesteiwr ar gyfer arallgyfeirio Cistanche yn gofyn am ffylogeni rhywogaeth sydd wedi'i ddatrys yn dda a data lletyol digon manwl.5. Casgliadau

Dyma'r dadansoddiad ffylogenetig moleciwlaidd cynhwysfawr cyntaf o'r genws planhigion holoparasitigCistanche, wedi'i ddosbarthu'n eang mewn rhanbarthau cras o'r Hen Fyd. Pedwar cladin mawr o fewnCistanchewedi'u nodi sydd ond yn cyfateb yn rhannol i adrannau a gydnabyddir yn draddodiadol (Beck Mannagetta, 1930) ac sy'n dangos elfen ddaearyddol gref yn gyffredinol. Tra bod Clad De-orllewin Asia yn arddangos strwythur ffylogenetig cryf ymhlith ac yn rhannol o fewn rhywogaethau (mae Clad Dwyrain Asia a Gogledd-orllewin Affrica yn unbenodol), mae cydraniad ffylogenetig o fewn y Clad Eang yn aml yn isel ac yn cael ei rwystro gan anghysondebau rhwng marcwyr niwclear a phlastig, sydd o leiaf yn rhannol sy'n ganlyniad croesrywio/mewnblygiad a/neu ddidoli llinach anghyflawn. Tystiolaeth ffylogenetig moleciwlaidd a chanlyniadau ailwerthusiad morffolegol oCistancherhywogaethau yn dynodi bod amrywiaeth rhywogaethau ynCistancheyn cael ei danamcangyfrif ar hyn o bryd (gweler y tacsa a nodir fel sp. nov. neu subsp. nov. yn y testun). Er bod yn rhaid cynnwys rhai rhywogaethau o hyd mewn unrhyw astudiaeth ffylogenetig moleciwlaidd (ee, C. mauritanica) a bydd angen marcwyr ychwanegol i ddatrys y berthynas rhwng pob rhywogaeth, mae'r rhagdybiaethau ffylogenetig cadarn a gyflwynir yma yn darparu sylfaen werthfawr ar gyfer cytogenetig, tacsonomig a bioddaearyddol parhaus. ymchwil yn y genws hwn.

cistanche deserticola

bienfaits cistanche


Ariannu

Mae'r gwaith hwn wedi'i gefnogi'n rhannol gan SYNTHESYS a ariannwyd gan Weithredu Seilwaith Ymchwil y Gymuned Ewropeaidd o dan Raglen "Capacities" FP7 yn y Real Jardín Botánico (ES-TAF-1663). Hoffem ddiolch i Brifysgol Bonn, yr OeAD (Österreichische Austauschdienst) a DAAD (Deutscher Akademischer Austauschdienst) am gymorth ariannol.

Datganiad cyfraniad awduraeth CRediT

Najibeh Ataei: Cysyniadoli, Curadu data, Dadansoddi ffurfiol, Caffael cyllid, Ymchwilio, Gweinyddu prosiectau, Delweddu, Ysgrifennu - drafft gwreiddiol, Ysgrifennu - adolygu a golygu.Gerald M. Schneeweiss: Cysyniadoli, Goruchwylio, Ysgrifennu - adolygu a golygu. Miguel Angel García: Adnoddau. Michael Krug: Dadansoddiad ffurfiol. Marcus Lehnert: Ysgrifennu - drafft gwreiddiol. JafarValizadeh: Adnoddau. Dietmar Quandt: Cysyniadoli, Dadansoddi ffurfiol, Gweinyddu prosiect, Adnoddau, Goruchwylio, Ysgrifennu - adolygu a golygu

Diolchiadau

Diolch i Edit Korpinos, a ddarparodd help yn labordy Jodrell yn Kew ac i guraduron y llysieufa (TARI, BM, IRAN, BONN, USB, P, TUH, E, W, KAS, MSB, K, B, G, PEY , M, UG, BR, GUH, MA, WU) am anfon benthyciadau a lluniau. Diolchwn i Susann Wicke am ddylunio paent preimio a chymorth labordy. Rydym yn gwerthfawrogi Dr Hossein Akhani ym Mhrifysgol Tehran a Mrs. Robabeh Shahi Shavvon ym Mhrifysgol Gilan am ddarparu peth deunydd DNA o Iran. Rydym yn ddiolchgar i Dr. FedericoLuebert a Juliana Chacon yn Sefydliad Nees am eu sylwadau defnyddiol.


Cyfeiriadau:

Álvarez, I., Wendel, JF, 2003. Dilyniannau ITS ribosomaidd a chasgliad ffylogenetig planhigion. Mol. Phylogenet. Evol. 29, 417–434. https://doi.org/10.1016/S1055-7903(03)00208-2.
Bailey, CD, Carr, TG, Harris, SA, Hughes, CE, 2003. Nodweddu polymorphism angiosperm nrDNA, paraleg, a ffugogenau. Mol. Phylogenet. Evol. 29, 435–455.
Baldwin, BG, Sanderson, MJ, Porter, JM, Wojciechowski, MF, Campbell, CS, Donoghue, MJ, 1995. Rhanbarth ITS o DNA ribosomaidd niwclear: ffynhonnell werthfawr o dystiolaeth ar ffylogeni angiosperm. Ann. Bot Missouri. Gard. 82, 247–277.
Beck-Mannagetta, G., 1930. Orobanchaceae, yn: Engler, A. (gol.), Das Pflanzenreich IV. 261. Wilhelm Engelmann, Leipzig, tt 1–348.
Bennett, JR, Mathews, S., 2006. Ffylogeny o'r teulu planhigion parasitig Orobanchaceae a gasglwyd o ffytocrom A. Am. J. Bot. 93, 1039–1051.
Blanco-Pastor, JL, Vargas, P., Pfeil, BE, 2012. Mae efelychiadau cyfunol yn datgelu hybrideiddio a didoli llinach anghyflawn yn Linaria Môr y Canoldir. PLoS UN 7 (6), e39089.
Borsch, T., Quandt, D., 2009. Deinameg mutational a defnyddioldeb ffylogenetig o DNA cloroplast noncoding. Syst Planhigion. Evol. 282, 169–199.

Bravo, GA, Antonelli, A., Bacon, CD, Bartoszek, K., Blom, MPK, Huynh, S., Jones, G., Knowles, LL, Lamichhaney, S., Marcussen, T., Morlon, H. , Nakhleh, LK, Oxelman,

B., Pfeil, B., Schliep, A., Wahlberg, N., Werneck, FP, Wiedenhoeft, J., WillowsMunro, S., Edwards, SV, 2019. Cofleidio heterogeneity: cyfuno Coed y Bywyd a dyfodol ffylogenomeg. PeerJ 7, e6399.

Doyle, JJ, Doyle, J., 1987. Gweithdrefn ynysu DNA gyflym ar gyfer meintiau bach o feinwe dail ffres. Ffytochem. Tarw. 19, 11–15.
N. Ataei, et al. Ffylogeneteg Foleciwlaidd ac Esblygiad 151 (2020) 106898 8
Felsenstein, J., 1981. Coed esblygiadol o ddilyniannau DNA: dull tebygolrwydd mwyaf. J. Mol. Evol. 17, 368–376.
Felsenstein, J., 1985. Cyfyngiadau hyder ar ffylogeneddau: ymagwedd gan ddefnyddio'r bootstrap. Esblygiad 39, 783–791.
Fu, W., Liu, X., Zhang, N., Song, Z., Zhang, W., Yang, J., Wang, Y., 2017. Profi'r rhagdybiaeth o darddiad lluosog holoparasitig yn Orobanchaceae: tystiolaeth ffylogenetig o'r ddau genera holoparasitig di-le olaf, Gleadovia a
Phacellanthus. Blaen. Gwydd Planhigion. 8, 1380.
Han, J.-P., Cân, J.-Y., Liu, C., Chen, J., Qian, J., Zhu, Y.-J., Shi, L.-C., Yao, H ., Chen, S.-L., 2010. AdnabodCistancherhywogaethau (Orobanchaceae) yn seiliedig ar ddilyniannau o'r rhanbarth rhynggenig plastid psbA-trnH. Acta Pharmaceut. Pechod. 45, 126–130.
Huelsenbeck, YH, Ronquist, F., 2001. MRBAYES: Casgliad Bayesaidd o goed ffylogenetig. Biowybodeg 17, 754–755.
Kress, WJ, Wurdack, KJ, Zimmer, EA, Weigt, LA, Janzen, DH, 2005. Defnyddio codau bar DNA i adnabod planhigion blodeuol. Proc. Natl. Acad. Sci. UDA 102, 8369–8374.

Li, X., Feng, T., Randle, C., Schneeweiss, GM, 2019. Perthynas ffylogenetig yn Orobanchaceae wedi'i gasglu o enynnau niwclear copi isel: cydgrynhoi cladau mawr a nodi safle newydd y clâd Orobanche nad yw'n ffotosynthetig chwaer i bob Orobanchaceae parasitig arall. Blaen. Gwydd Planhigion. 10, 902.

Li, X., Jang, T.-S., Temsch, EM, Kato, H., Takayama, K., Schneeweiss, GM, 2017. Mae data moleciwlaidd a chariolegol yn cadarnhau bod y genws enigmatig Platypholis o Ynysoedd Bonin (SE Japan ) wedi'i nythu'n ffylogenetig o fewn Orobanche
(Orobanchaceae). J. Planhigyn. Res. 130, 273–280.
Li, X., Zhang, T.-C., Qiao, Q., Ren, Z., Zhao, J., Yonezawa, T., Hasegawa, M., Crabbe, MJC, Li, J., Zhong, Y ., 2013. Dilyniant genom cloroplast cyflawn o holoparasiteCistanchemae deserticola (Orobanchaceae) yn datgelu colled genynnau a genyn llorweddol
trosglwyddo o'i westeiwr Haloxylon ammodendron (Chenopodiaceae). PLoS UN 8, e58747.
Liu, X., Fu, W., Tang, Y., Zhang, W., Cân, Z., Li, L., Yang, J., Ma, H., Yang, J., Zhou, C.,
Davis, CC, Wang, Y., 2020. Trywyddiadau amrywiol o ddiraddiad plastome mewn holoparasitigCistanchea lleoliad genomig y genynnau plastid coll. J. Exp. Bot. 71, 877–892.
Maddison, W., Knowles, LL, 2006. Inferring phylogeny er gwaethaf didoli llinach anghyflawn. Syst. Biol. 55, 21–30.
Manen, J.-F., Habashi, C., Jeanmonod, D., Park, J.-M., Schneeweiss, GM, 2004. Phylogeny ac amrywioldeb intraspecific o holoparasitig Orobanche (Orobanchaceae) casglu o ddilyniannau plastid rbcL. Mol. Phylogenet. Evol. 33, 482–500.
McNeal, JR, Bennett, JR, Wolfe, AD, Mathews, S., 2013. Phylogeny a tharddiad holoparasitig yn Orobanchaceae. Yn. J. Bot. 100, 971–983.
Müller, J., Müller, KF, Neinhuis, C., Quandt, D., 2006. PhyDE – Golygydd Data Phylogenetic. http://www.phyde.de (cyrchwyd 2. Ebrill 2019).
Müller, K., 2004. PRAP-cyfrifo cefnogaeth Bremer ar gyfer setiau data mawr. Mol. Phylogenet. Evol. 31, 780–782.
Müller, K., 2005. SeqState: ystadegau dylunio a dilyniannu paent preimio ar gyfer setiau data DNA ffylogenetig. Appl. Biowybod. 4, 65–69.
Nixon, KC, 1999. Mae'r glicied parsimony yn ddull newydd o ddadansoddi parsimony yn gyflym. Cladistig 15 , 407–414.
Olsson, S., Buchbender, V., Enroth, J., Hedenäs, L., Huttunen, S., Quandt, D., 2009. Mae dadansoddiadau ffylogenetig yn datgelu lefelau uchel o amryliw ymhlith llinachau plewrocarpaidd yn ogystal â chladinau newydd. Bryolegydd 112, 447–466.
Park, J.-M., Manen, J.-F., Colwell, AE, Schneeweiss, GM, 2008. Ffylogeni genyn plastid o'r Orobanche parasitig nad yw'n ffotosynthetig (Orobanchaceae) a genera cysylltiedig. J. Plant Res. 121, 365–376.
Payseur, BA, Rieseberg, LH, 2016. Mae persbectif genomig ar hybridization a speciation.... Mol. Ecol. 25, 2337–2360.
Quandt, D., Müller, K., Huttunen, S., 2003. Nodweddu rhanbarth psbTH DNA cloroplast a dylanwad elfennau cymesurol dyad ar adluniadau ffylogenetig. Biol Planhigion. 5, 400–410. https://doi.org/10.1055/s-2003-42715.
Rambaut, A., Drummond, AJ, Xie, D., Baele, G., Suchard, MA, 2018. Crynhoad ôl-raddedig mewn ffylogeneteg Bayesaidd gan ddefnyddio Tracer 1.7. Syst. Biol. 67, 901–904.

Rieseberg, LH, Carney, SE, 1998. Croesrywio planhigion. Ffytol Newydd. 140, 599–624.

Rodrigues, AG, Colwell, AEL, Stefanovic, S., 2011. Systemateg moleciwlaidd y genws parasitig Conopholis (Orobanchaceae) wedi'i gasglu o ddilyniannau plastid a niwclear. Yn. J. Bot. 98, 896–908.
Ronquist, F., Huelsenbeck, YH, 2003. MrBayes 3: Casgliad ffylogenetig Bayesaidd o dan fodelau cymysg. Biowybodeg 19, 1572–1574.
Schneeweiss, GM, 2013. Perthynas ffylogenetig a thueddiadau esblygiadol yn Orobanchaceae, yn Joel, DM, Gressel, J., Musselman, LJ (Gol.), Orobanchaceae Parasitig. Springer, Berlin Heidelberg, tt. 243–265.
Schneeweiss, GM, Colwell, A., Park, J.-M., Jang, C.-G., Stuessy, TF, 2004a. Ffylogeny Orobanche holoparasitig (Orobanchaceae) wedi'i gasglu o ddilyniannau ITS niwclear. Mol. Phylogenet. Evol. 30, 465–478.
Schneeweiss, GM, Frajman, B., Dakskobler, I., 2009. Orobanche lycoctoni Rhiner (Orobanchaceae), rhywogaeth adnabyddus o fflora Canol Ewrop. Candollea 64, 91–99.
Schneeweiss, GM, Palomeque, T., Colwell, AE, Weiss-Schneeweiss, H., 2004b. Rhifau cromosom ac esblygiad caryoteip mewn Orobanche holoparasitig (Orobanchaceae) a genera cysylltiedig. Yn. J. Bot. 91, 439–448.
Schneider, AC, Colwell, AEL, Schneeweiss, GM, Baldwin, BG, 2016. Amrywiaeth cryptig gwesteiwr-benodol ymhlith broomrapes hemisffer gorllewinol (Orobanche sl, Orobanchaceae). Ann. Bot. 118, 1101–1111.
Simmons, AS, Ochoterena, H., 2000. Bylchau fel cymeriadau mewn dadansoddiadau ffylogenetig seiliedig ar ddilyniant. Syst. Biol. 49, 369–381.
Stamatakis, A., 2014. RAxML Fersiwn 8: Offeryn ar gyfer dadansoddi ffylogenetig ac ôl-ddadansoddiad o ffylogenïau mawr. Biowybodeg 30, 1312–1313.
Stöver, BC, Müller, KF, 2010. TreeGraph 2: cyfuno a delweddu tystiolaeth o wahanol ddadansoddiadau ffylogenetig. BMC Bioinf. 11, 7.
Haul, ZY, Cân, JY, Yao, H., Han, JP, 2012. Adnabod moleciwlaidd oCistanchesHerba a'i godinebwyr yn seiliedig ar ddilyniant nrITS2. J. Med. Planhigyn Res. 6, 1041–1045.

Swofford, DL, 1999. PAUP*4.0 Beta ar gyfer Macintosh: Dadansoddiad Ffylogenetig gan Ddefnyddio Parsimony. Sinauer Associates, Sunderland, MA.

Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G., Bouvet, J., 1991. Preimio cyffredinol ar gyfer ymhelaethu ar dri rhanbarth di-godio o DNA cloroplast. Planhigyn Mol. Biol. 17, 1105–1109.Tomari, N., Ishizuka, Y., Moriya, A., Kojima, S., Deyama, T., Coskun, M., Tu, P.,

Mizukami, H., 2003. Astudiaethau ffarmacognostical o berthynas ffylogenetig Cistanchis Herba (IV) o'rCistancheplanhigion yn seiliedig ar plastid rps2 genyn a rpl16-rpl14 dilyniant rhanbarth spacer rhynggenig. Natur. Med. 57, 233–237.
Tomari, N., Ishizuka, Y., Moriya, A., Kojima, S., Deyama, T., Mizukami, H., Tu, P., 2002. Astudiaethau Pharmacognostical o Cistanchis Herba (III) perthynas ffylogenetig yCistancheplanhigion yn seiliedig ar plastid rps2 genyn a rpl16-rpl14 dilyniannau bylchwr rhynggenig. Biol. Pharm. Tarw. 25, 218–222.
Vrancken, J., Wesselingh, RA, 2010. Etifeddiaeth y genom cloroplast yn Rhinanthus angustifolius (Orobanchaceae). Planhigion Ecol. Evol. 143, 239–242.
Wang, X.-Y., Xu, R., Chen, J., Song, J.-Y., Newmaster, SG, Han, J.-P., Zhang, Z., Chen, S.-L. , 2018. CanfodCistanchesCynhyrchion meddyginiaethol Herba (Rou Cong Rong) gan ddefnyddio llofnodion niwcleotidau rhywogaeth-benodol. Blaen. Gwydd Planhigion. 9, 1643.

Weiss-Schneeweiss, H., Greilhuber, J., Schneeweiss, GM, 2006. Esblygiad maint genom mewn Orobanche holoparasitig (Orobanchaceae) a genera cysylltiedig. Yn. J. Bot. 93, 148–156.

Westwood, JH, Yoder, JI, Timko, AS, dePamphilis, CW, 2010. Esblygiad parasitiaeth mewn planhigion. Tueddiadau Gwyddonol Planhigion. 15, 227–235.

White, T., Bruns, T., Lee, S., Taylor, J., 1990. Ymhelaethu a dilyniannu'n uniongyrchol genynnau RNA ribosomaidd ffwngaidd ar gyfer ffylogenetig. Yn: Innis, M., Gelfand, D., Shinsky, J., White, T. (Gol.), Protocolau PCR: Canllaw i Ddulliau a Chymwysiadau. Academaidd

Press, Llundain, tt. 315–322.
Wicke, S., 2013. Esblygiad genomig yn Orobanchaceae. Yn: Joel, DM, Gressel, J., Musselman, LJ (Gol.), Orobanchaceae Parasitic. Springer, Berlin Heidelberg, tt. 267–286.
Wicke, S., Müller, KF, dePamphilis, CW, Quandt, D., Wickett, NJ, Zhang, Y., Renner,
SS, Schneeweiss, GM, 2013. Mecanweithiau lleihau genom swyddogaethol a chorfforol mewn planhigion parasitig ffotosynthetig ac anffotosynthetig o'r teulu banadl. Cell Planhigion 25, 3711–3725.
Wicke, S., Müller, KF, dePamphilis, CW, Quandt, D., Bellot, S., Schneeweiss, GM, 2016. Model mecanyddol o amrywiad cyfradd esblygiadol ar y ffordd i ffordd o fyw anffotosynthetig mewn planhigion. Proc. Natl. Acad. Sci. UDA 113, 9045–9050.

Wickett, NJ, Honaas, LA, Wafula, EK, Das, M., Huang, K., Wu, B., Landherr, L., Timko, AS, Yoder, J., Westwood, JH, dePamphilis, CW, 2011 ■ Mae trawsgrifiadau o'r teulu planhigion parasitig Orobanchaceae yn datgelu cadwraeth cloroffyl yn syndod

synthesis. Curr. Biol. 21, 2098–2104.
Wolfe, AD, Randle, CP, Liu, L., Steiner, KE, 2005. Phylogeny a bioddaearyddiaeth Orobanchaceae. Folia Geobot. 40, 115–134.
Worberg, A., Quandt, D., Barniske, A.-M., Löhne, C., Hilu, KW, Borsch, T., 2007. Phylogeny o eudicots gwaelodol: Mewnwelediadau o DNA nad yw'n codio ac sy'n datblygu'n gyflym. Organ. Deifwyr. Evol. 7, 55–77.
Young, ND, Steiner, KE, dePamphilis, CW, 1999. Esblygiad parasitiaeth mewn Scrophulariaceae/Orobanchaceae: mae dilyniannau genynnau plastid yn gwrthbrofi cyfres drawsnewid esblygiadol. Ann. Bot Missouri. Gard. 86, 876–893.
Zhang, ZY, 1990. Orobanchaceae, yn: Wang, W. (gol.), Flora Reipublicae Popularis Sinica , cyf. 69. Beijing, Science Press, tt. 69–124.
Zhang, ZY, Tzvelev, NN, 1998. Orobanchaceae, yn: Wu, ZY, Raven, PH (Gol.), Flora of China, cyf. 18 (Scrophulariaceae trwy Gesneriaceae). Science Press, Beijing, a Missouri Botanical Garden Press, St. Louis, MI, tt. 229–243.
Zheng, S., Jiang, X., Wu, L., Wang, Z., Huang, L., 2014. Gwahaniaethu cemegol a genetig oCistanchesHerba yn seiliedig ar UPLC-QTOF/MS a chodio bar DNA. PLoS ONE 9 (5), e98061.



Fe allech Chi Hoffi Hefyd