Rôl Profion Genetig yng Ngweithred Diagnostig Cleifion Pediatrig â Chlefydau Arennau: Profiad Sefydliad Sengl Ⅱ

Caniataodd CES ac astudiaethau arwahanu teuluol nodi amrywiadau achosol mewn cyfran sylweddol o gleifion

Cafodd pob claf CES a chawsant eu dadansoddi ar gyfer blaenoriaethu amrywiadau ac anodi yn dilyn y meini prawf a ddisgrifir uchod (Ffig. 1). Yn gyffredinol, canfuwyd amrywiadau mewn 154 o gleifion (80.6%) gyda 37 o gleifion (19.4%) heb gyflwyno unrhyw amrywiadau. Mae dilysiad Sanger o'r amrywiad(au) a nodwyd ac astudiaethau gwahanu teulu wedi'u cynnal hyd yn hyn mewn 90 allan o'r 154 o gleifion (58.4%). Roedd y dull hwn yn caniatáu i ni (i) gadarnhau'r amrywiadau a nodwyd gan CES ym mhob achos, (ii) cadarnhau eu gwahaniad â'r ffenoteip, a (iii) nodi amrywiadau de novo. Ymhlith y grŵp o gleifion y nodwyd amrywiadau ynddynt gan CES, cafwyd adroddiad genetig terfynol mewn 71 (46.1%; mewn 49 o gleifion, dilyswyd amrywiadau gan ddilyniannu Sanger ac astudiaethau gwahanu teulu), tra bod 22 (14.3%) a 61 ( Arhosodd 39.6% o gleifion â diagnosis genetig ansicr neu fe'u dosbarthwyd yn amhendant, yn y drefn honno (Ffig. 3).

Yn gyffredinol, roedd cymhwyso CES ac yna, pryd bynnag y bo modd, astudiaethau gwahanu teuluol yn ein galluogi i gyrraedd diagnosis genetig mewn cyfran sylweddol o achosion. Mae'r cynnyrch diagnostig yn heterogenaidd wrth ystyried y gwahanol gategorïau macro clefyd gyda ciliopathi yn dangos y gyfradd ddiagnostig uwch (74.4% o gleifion wedi'u diagnosio), ac yna nephrolithiasis a thiwlopathies (45.5% a 45%, yn y drefn honno), glomerulopathies a CAKUT (24.2 a 20.6). %). Y macro-gategori "eraill" oedd yr un mwyaf heterogenaidd a chyflwynodd y cynnyrch diagnostig isaf, gyda dim ond 1 claf yn cael diagnosis genetig allan o 14 (7.1%; Tabl 1). Nid yw’n syndod, wrth ystyried teulu cadarnhaol yn erbyn teulu negyddol ei dori, dangosodd y grŵp blaenorol o gleifion gyfradd ddiagnostig uwch gyda 59.5% o gleifion wedi’u diagnosio (Tabl 1).

CLICIWCH YMA I GAEL CISTANCHE O'R ANSAWDD UCHAF AR GYFERCLEFYDAU GLOMERULAR

Dosbarthiad a nodweddion amrywiol yn y garfan o gleifion a gafodd ddiagnosis

Wrth edrych ar y cleifion ag adroddiad genetig terfynol, cafodd 96 o amrywiadau mewn 32 o enynnau eu nodi a'u rhestru yn adroddiadau genetig cleifion (Ffig. 4a a Ffeil Ychwanegol 1: Tablau S1-S6). Gellir tynnu ychydig o ystyriaethau wrth ddadansoddi'r data: (i) Cyflwynodd sawl claf fwy nag un amrywiad naill ai yn yr un genynnau neu mewn genynnau gwahanol, heb ystyried yr amrywiadau heterosygaidd cyfansawdd mewn genynnau enciliol (ee, #41, #43, # 109; Ffig. 4a a Ffeil ychwanegol 1: Tablau S2, S3). Mae cyfran sylweddol o'r achosion hyn yn perthyn i'r categori macro ciliopathi ac yn benodol iclefyd yr arennau polycystig, gan ofyn a allai amrywiadau ychwanegol o fewn y genyn PKD1 gael effaith glinigol, gan arwain at ddiagnosis cynharach (llawysgrif wrth baratoi). (ii) Y genynnau a oedd yn treiglo fwyaf dro ar ôl tro o fewn y garfan oedd COL4A5 a PKD1, yn unol ag amlder clefydau clefyd yr arennau polysystig sy'n dominyddu gan Alport ac awtosomaidd (ADPKD). (iii) Treigladau missense yw'r rhan fwyaf o'r amrywiadau a nodwyd (n=53; 55.2%), ac yna newid ffrâm (n=15; 15.6%), nonsens (n=14; 145.6%) , a splicing amrywiadau (n=9; 9.4%). Ar ben hynny, adroddwyd 5 CNV gwahanol yn cynnwys genynnau achosol o CAKUT neu glefydau glomerwlaidd (5.2%; Ffig. 4a a Ffle 1 Ychwanegol: Tablau S1-S6). (iv) Nephrolithiasis a thiwbwlopathïau a gyflwynodd y nifer uchaf o amrywiadau C5 (n=6 ac n=4, yn y drefn honno) a’r nifer isaf o dreigladau C3 (n=1 yr un), a oedd ymlaen cynrychiolir y gwrthwyneb yn uchel mewn ciliopathi (n=20). Roedd amrywiadau C4 yn cynrychioli'r mwyafrif o dreigladau ymhlith yr holl gategorïau macro-clefyd (Ffig. 4b).

v) O fewn yr adroddiadau genetig terfynol, arweiniodd CES at nodi amrywiadau pathogenig C5 mewn 17 o gleifion (24%), amrywiadau pathogenig C4 tebygol mewn 34 (47.9%), amrywiadau o arwyddocâd anhysbys-VUS C3 mewn 16 pwnc (22.5%) ac mewn 4 achos, amrywiadau a ddosbarthwyd fel C3/C4 (5.6%). Wrth edrych ar y math o amrywiadau/amledd o fewn cleifion a modd etifeddu, roedd mwyafrif yr amrywiadau C5 yn dreigladau heterosygaidd (n=8), ac yna homosygaidd (n=6) a heterosygaidd cyfansawdd (n =2) amrywiad. Roedd CNV C5 yn rhan o'r categori hwn. Ymddangosodd patrwm dosbarthiad tebyg ar gyfer amrywiadau C4 a C3, gyda threigladau heterosygaidd yn cael eu cynrychioli fwyaf (n=23 ac n=9, yn y drefn honno; Ffig. 4c).

(vi) Ni amlygwyd unrhyw wahaniaethau arwyddocaol yn y gyfradd ddiagnostig wrth ystyried pynciau Ewropeaidd yn erbyn pynciau nad ydynt yn rhai Ewropeaidd, er bod rhaid cymryd mewn cof mai'r grŵp cyntaf oedd yn cynrychioli mwyafrif helaeth y garfan. Yn olaf, (vii) yn annibynnol ar y categori clefyd a ystyriwyd, roedd y rhan fwyaf o'r amrywiadau a nodwyd eisoes wedi'u cyhoeddi ac yn gysylltiedig â ffenoteipiau clinigol penodol (Ffig. 4d). Ciliopathies, ac yn arbennig clefyd amlsystig yr arennau, oedd yr unig amheuaeth a oedd yn cyflwyno nifer sylweddol o amrywiadau heb eu cyhoeddi (13 allan o 46), yn ôl pob tebyg oherwydd y nifer uwch o amrywiadau a nodwyd o gymharu â chategorïau clefydau eraill. Manylir ar yr holl amrywiadau a nodwyd yn Ffeil ychwanegol 1: Tablau S1–S6.

Trafodaeth

Anodd yn brin mewn plant,CKDyn cael effaith negyddol iawn ar dwf a datblygiad arferol, gan gyfaddawdu ar faint ac ansawdd bywyd. Mae’r dadansoddiadau diweddaraf ar gleifion sy’n oedolion a chleifion pediatrig, sydd wedi cael trawsblaniad aren neu sydd wedi’u cynnwys ar y rhestr aros am drawsblaniad neu sy’n bresennol yng nghofrestrfeydd y Gymdeithas Arennol Ewropeaidd-Cymdeithas Dialysis a Thrawsblaniadau Ewrop (ERA-EDTA) yn dangos bod hyd at Mae 27% ohonynt heb eu diagnosio ar adeg trawsblannu [7]. Yn unol â'r data hyn, trwy ddadansoddi Cofrestrfa Trawsblaniadau Canolfan Trawsblannu Genedlaethol yr Eidal, fe wnaethom adrodd yn ddiweddar fod tua 17.2% o'r garfan bediatrig heb ddiagnosis clinigol clir [6]. Yn ogystal, wrth ystyried y gwahanol gategorïau o glefydau, effeithiwyd ar y mwyafrif helaeth gan gyflyrau prin a hyd at 50% gan glefyd monogenig [6]. Mae'r canlyniadau hyn yn awgrymu y gallai sgrinio genetig fod yn ychwanegiad gwerthfawr ar gyfer cynyddu'r gyfradd ddiagnostig. Mae hefyd yn arf grymus i gadarnhau diagnosis clinigol, yn ogystal â deall y geneteg sy'n tanlinellu clefydau mwy cymhleth neu syndromig, gan effeithio yn y pen draw ar brognosis, rheolaeth, a thriniaeth cleifion.

Yma, rydym yn adrodd ar ganlyniadau'r defnydd systematig o brawf genetig pwerus, CES o'r fath yng ngwaith diagnostig cleifion pediatrig yr effeithir arnynt gan neffropathi. Yn gyffredinol, cafwyd prawf genetig terfynol, yn seiliedig ar CES ac yna astudiaethau arwahanu yn seiliedig ar Sanger, mewn 37.1% o gleifion, gyda rhywfaint o heterogenedd wrth ystyried y gwahanol gategorïau o glefydau. Yn ôl y disgwyl, yn seiliedig ar gyflwyniad clinigol, cafwyd y cyfraddau canfod uchaf ar gyfer ciliopathies (74.4%), ac yna nephrolithiasis (45.5%) a chlefydau tiwbaidd (45%), tra bod y rhan fwyaf o glefydau glomerwlaidd a CAKUT yn parhau heb eu diagnosio. Yn achos clefydau glomerwlaidd, mae prawf genetig negyddol yn bwysig ynddo'i hun gan ei fod yn diystyru achos strwythurol y clefyd, gyda goblygiadau sylweddol i reolaeth glinigol a chanlyniad trawsblannu.

Mae'r data hyn yn unol â chanlyniadau a gyhoeddwyd yn flaenorol, er y gellir cofrestru rhai gwahaniaethau yn seiliedig ar y grŵp o gleifion a ystyriwyd, yn enwedig ar gyfer carfannau hynod homogenaidd sy'n seiliedig yn bennaf ar yr un grŵp ethnig (Tabl 2). Mae'n rhaid nodi bod llawer o'r teuluoedd lle nodwyd VUS ar hyn o bryd yn cael eu hymchwilio ar gyfer gwahanu amrywiadau, gan wella'r perfformiadau hyn yn fwyaf tebygol.

Mae'r canlyniadau hyn yn tanlinellu pwysigrwydd prawf genetig yn seiliedig ar NGS ynghyd ag astudiaethau gwahanu teulu a/neu brofion cyflenwol (ee, MLPA, arae-CGH) fel rhan o'r llifoedd gwaith diagnostig arferol. Yn ogystal â pherthnasedd cael diagnosis, mae'r profion hyn yn ein galluogi i nodi aelodau eraill o'r teulu a allai gario'r un amrywiadau pathogenig yn ogystal ag amcangyfrif y risg y bydd afiechyd yn digwydd eto. Ar ben hynny, o ystyried bod canran sylweddol o'r rhainmae angen trawsblannu aren ar gleifionar ryw adeg, mae argaeledd prawf genetig i sgrinio aelodau'r teulu yn dwyn goblygiadau pwysig wrth ddewis rhoddwr byw o fewn y teulu.

Ail bwynt i'w drafod yw pwysigrwydd gwahaniaethu rhwng achosion genetig ac anenetig ar gyfer rhai afiechydon. Er enghraifft, ym mhresenoldeb plentyn â syndrom nephrotic sy'n gwrthsefyll steroid (SRNS), mae'n hanfodol diystyru amodau a achosir gan fwtaniadau mewn genynnau sy'n codio ar gyfer proteinau adeileddol y podocyte. Gall hyn helpu i fireinio therapi, gan nad yw plant sy'n cario amrywiadau pathogenig mewn genynnau podocyte yn gyffredinol yn elwa o therapi gwrthimiwnedd neu ragfynegi prognosis, gan fod SRNS "imiwnolegol" yn fwy tebygol o ddigwydd eto ar ôl trawsblannu. Gall diagnosis genetig hefyd arwain at laibiopsïau arennau, yn enwedig ar gyfer cleifion â glomerwlopathi.

Trydydd ystyriaeth berthnasol o blaid profion genetig yn llif gwaith diagnostig clinigol cleifion pediatrig yw effaith drosiadol adnabod amrywiadau genetig. Yn wir, mae genynnau gweithredadwy sy'n golygu y gellir trin yr amodau afiechyd cyfatebol yn seiliedig ar bresenoldeb amrywiadau pathogenig, fel yn achos rhwystr renin-angiotensin ar gyfer cleifion sy'n cario amrywiadau pathogenig mewn genynnau COL4A3/COL4A4/COL4A5. Ar yr un llinell, gallai cael adroddiad genetig osgoi triniaeth ddiwerth neu hyd yn oed niweidiol, megis therapïau gwrthimiwnedd ar gyfer cleifion sy'n cario mwtaniadau mewn genynnau codio colagen [5]. Ar ben hynny, gall fod yn ddefnyddiol ar gyfer haeniad cleifion ac i asesu'r risg bosibl y bydd yn digwydd eto ar ôl trawsblaniad aren. Er enghraifft, mae cleifion sy'n cael diagnosis o Syndrom Uremig Hemolytig annodweddiadol a chydag adroddiad genetig cadarnhaol yn nodi amrywiadau pathogenig mewn genynnau CFH, C3 neu CFB, mewn perygl cymedrol i uchel o ailddigwydd ar ôl trawsblannu [28]. Iddynt hwy, dangosodd gweinyddu eculizumab ganlyniadau cadarnhaol sylweddol heb unrhyw atglafychiad nac atglafychiad mewn lleiafrif o achosion, tra gellir osgoi ei weinyddu ar gyfer y cleifion hynny sydd â risg isel [28-30].

Mae pedwerydd pwynt yn ymwneud â chynllunio teulu, gan ein bod yn ymdrin â phoblogaeth bediatrig sydd â rhieni a allai ddymuno cael plant ychwanegol. Gall argaeledd diagnosis genetig fod yn hynod ddefnyddiol ar gyfer cwnsela genetig sy'n cynnig yr holl opsiynau sydd ar gael i'r cwpl ar gyfer beichiogrwydd yn y dyfodol. Yn unol â'r pwynt hwn, o ystyried y garfan bresennol, mewn 2 achos gwahanol gwnaed diagnosis cyn-geni trwy ddilyniannu Sanger, gan sgrinio'r ffetws ar gyfer yr amrywiad penodol a ddarganfuwyd yn wreiddiol gan CES yn y proband.

Mae pedwerydd pwynt y mae angen ei bwysleisio yn ymwneud â nifer yr amrywiadau C3-VUS a nodwyd gan NGS, sydd bob amser yn peri penbleth difrifol ynghylch eu rôl o ran cychwyn a datblygiad afiechyd a sut y gellir eu cyfathrebu yn ystod cwnsela genetig. Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, aethpwyd i'r afael â'r pwnc hwn trwy sefydlu a dylunio methodolegau cyfrifiannol newydd sy'n ystyried nid yn unig cadwraeth niwcleotid, ac effaith protein ond hefyd rhwydweithiau cymdeithas genynnau a chysylltiadau llwybr. Gall awgrymiadau ychwanegol wrth ddehongli gwir ystyr amrywiadau C3 ddod o ddadansoddiadau trawsgrifio trwy ganfod mynegiant aberrant neu fecanweithiau splicing afreolaidd, yn ogystal ag astudiaethau dilysu swyddogaethol [31, 32]. Yn olaf, mae'n bwysig pwysleisio perthnasedd ail-ddadansoddiad cyfnodol o adroddiadau genetig negyddol neu amhendant ac ailwerthusiad cyfnodol o amrywiadau C3. Mae’r math hwn o ddull yn dibynnu ar (i) darganfod cysylltiadau genynnau-clefyd/clefyd amrywiad-newydd, (ii) gwybodaeth wedi’i diweddaru o gronfeydd data sydd ar gael yn gyhoeddus, (iii) dosbarthu amrywiadau genetig yn seiliedig ar dystiolaeth swyddogaethol, (iv) gwella’r mewn offer silico a ddefnyddir ar gyfer aliniad data ac anodi amrywiadau [33]. Hyd yn hyn, nid oes unrhyw arwydd clir o'r cyfnod amser ar gyfer ail-ddadansoddi achosion negyddol/amhendant neu amrywiadau C3 wedi'i ddarparu gan Gymdeithas Geneteg Dynol yr Eidal (SIGU) na chanllawiau Coleg Geneteg Feddygol a Genomeg America. Fodd bynnag, mae'r ddau sefydliad hyn yn awgrymu adolygu achosion negyddol neu ddosbarthiad amrywiad naill ai yn seiliedig ar ganfyddiadau newydd gan y labordy neu gan ffynonellau allanol (ee, llenyddiaeth neu gronfeydd data) neu yn dilyn ceisiadau clinigwyr [34-36]. Yn unol â'r pwynt trafod olaf hwn, mae'n werth nodi, mewn rhai achosion, y darganfuwyd un amrywiad mewn genynnau enciliol sy'n hynod gydnaws â'r ffenoteip clinigol. Er fel y cyfryw, ni all yr amrywiadau hyn esbonio cyflwyniad clinigol, mae'n bwysig ail-ddadansoddi ac o bosibl ail-alinio data dilyniannu gwreiddiol i benderfynu a ellir dod o hyd i ail amrywiad achosol.

Pwynt olaf i'w drafod yw effaith ariannol y profion hyn ar y system Gofal Iechyd Cenedlaethol. Yn y system Eidalaidd, CES wedi'i ddilyn gan ddadansoddiadau o nifer gyfyngedig o enynnau (<8) is in the range of 1200 euros, all included, while larger panels are approximately double the amount. While these costs may seem elevated, a timely diagnosis may avoid unnecessary additional tests, including biopsies and may lead to optimized patient care and to early identification of family members with the same disease or at risk of developing the same disease. Family segregation studies are in the range of 150 euros per variant tested per person. In our view, to make this diagnostic work efficient and sustainable, it is necessary to identify local/ regional "reference hubs" that can centralize these analyses, reducing costs and accumulating essential experience in variant calling and interpretation.

Ar y cyfan, mae'r canlyniadau hyn yn cadarnhau perthnasedd cynnwys profion genetig arferol a chynghori yn llif gwaith diagnostig cleifion pediatrig yr effeithir arnynt gan neffropathi pan amheuir bod cyflwr monogenig neu sydd â hanes teuluol cadarnhaol. Ar gyfer y cleifion hyn, dylid ystyried profion genetig ar ddechrau eu taith ddiagnostig, gan y gallai wella rheolaeth glinigol, rhoi triniaethau diangen dros ben, neu weithdrefnau diagnostig, nodi aelodau eraill o’r teulu a allai fod mewn perygl o gael yr un amrywiadau genetig ac, rhag ofn y byddtrawsblaniad aren, yn arwain at y dewis gorau posibl o roddwyr byw.

Cyfeiriadau

1. Singh P, Harris PC, Sas DJ, Lieske JC. Geneteg clefyd cerrig yr arennau

2. a nephrocalcinosis. Nat Parch Nephrol. 2022; 18(4): 224–40. Raina R, Vijayvargiya N, Khooblall A, Melachuri M, Deshpande S, Sharma D, Mathur K, Arora M, Sethi SK, Sandhu S. Hemolytig annodweddiadol pediatrig

3. datblygiadau syndrom uremig. Celloedd. 2021; 10(12): 3580. Kagan M, Pleniceanu O, Vivante A. Sail enetig anomaleddau cynhenid ​​yr aren a'r llwybr wrinol. Pediar Nephrol. 2022; 37: 2231. 4. Torra R, Furlano M, Ortiz A, Ars E. Clefydau genetig yr arennau fel achos heb ei gydnabod yn ddigonol o glefyd cronig yn yr arennau: rôl allweddol adroddiadau cofrestrfa ryngwladol. Clin Arennau J. 2021;14(8):1879–85.

5. Cyfranogwyr KC. Geneteg mewn clefyd cronig yn yr arennau: casgliadau o Gynhadledd Dadleuol Clefyd yr Arennau: Gwella Canlyniadau Byd-eang (KDIGO). Arennau Int. 2022; 101(6): 1126–41.

6. Vaisitti T, Peritore D, Magistroni P, Ricci A, Lombardini L, Gringeri E, Catalano S, Spada M, Sciveres M, Di Giorgio A, et al. Amlder clefydau prin a monogenig mewn derbynwyr trawsblaniadau organau pediatrig yn yr Eidal. Orphanet J Rare Dis. 2021; 16(1):374.

7. Kramer A, Boenink R, Stel VS, Santiuste de Pablos C, Tomovic F, Golan E, Kerschbaum J, Seyahi N, Ioanou K, Beltran P, et al. Adroddiad Blynyddol Cofrestrfa ERA-EDTA 2018: crynodeb. Clin Arennau J. 2021;14(1):107–23.

8. Domingo-Gallego A, Pybus M, Bullich G, Furlano M, Ejarque-Vila L, Lor ente-Grandoso L, Ruiz P, Fraga G, Lopez Gonzalez M, Pinero-Fernandez JA, et al. Defnyddioldeb clinigol profion genetig mewn clefyd yr arennau sy'n dechrau'n gynnar: saith genyn yw'r prif chwaraewyr. Nephrol Dial Transpl. 2022; 37(4):687–96.

9. Tullus K, Webb H, Bagga A. Rheoli syndrom nephrotic sy'n gwrthsefyll steroid mewn plant a phobl ifanc. Lancet Iechyd Plant Glasoed. 2018; 2(12):880–90. 10. Kienzl-Wagner K, Waldegger S, Schneeberger S. Clefyd yn dychwelyd-y cleddyf damocles yn trawsblannu aren ar gyfer glomerulosclerosis segmentol prif ffocws. Immunol blaen. 2019; 10: 1669

Gwasanaeth Cefnogol Wecistanche - Yr allforiwr cistanche mwyaf yn Tsieina:

E-bost:wallence.suen@wecistanche.com

Whatsapp/Ffôn:+86 15292862950

Siop Am Fwy o Fanylion:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop

CLICIWCH YMA I GAEL DYFYNIAD O'R CYLCH ORGANIG NATURIOL GYDA 25% ECHINACOSIDE A 9% ACTEOSIDE AR ​​GYFER Haint YR ARennau